数据集概述
本数据集记录了蓝鲶鱼野生与养殖群体的SNP标记发现与验证过程，通过基因分型测序技术对5个群体190个个体进行分析，筛选出4275个SNP位点，并使用Sequenom MassARRAY验证了64个SNP标记。数据包含合并的SNP文件及说明文档，支持蓝鲶鱼群体遗传结构分析与遗传标记开发。
文件详解
- 文件名称：README_for_all.mergedSNPs.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：蓝鲶鱼SNP标记发现与验证研究的说明文档，包含数据处理流程、群体信息、SNP筛选标准及验证方法等背景信息。
- 文件名称：all.mergedSNPs.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：合并后的SNP数据文件，包含通过基因分型测序技术获得的蓝鲶鱼群体SNP位点信息，支持群体遗传学分析与标记筛选。
数据来源
论文“Data from: SNP discovery in wild and domesticated populations of blue catfish, Ictalurus furcatus, using genotyping-by-sequencing and subsequent SNP validation”
适用场景
- 蓝鲶鱼群体遗传结构分析: 利用SNP位点数据研究野生与养殖群体的遗传多样性、种群结构及亲缘关系。
- 水产养殖遗传标记开发: 筛选高信息度SNP标记，用于蓝鲶鱼育种中的亲缘鉴定、种群溯源及遗传改良。
- 水生生物遗传学研究: 作为低先验遗传信息物种快速开发遗传标记的方法学案例，指导其他水产物种的SNP标记研究。
- 养殖群体遗传管理: 分析养殖与野生群体的基因交流情况，为蓝鲶鱼养殖种群的遗传资源保护提供数据支持。
