数据集概述
本数据集为论文“From crystallographic data to solution structure of photoreceptors: the case of AppA BLUF domain”的原始支撑数据，包含四个Excel文件，分别记录FMN及残基化学位移、FMN激发能、ASN-OD1与FMN-H3距离、QM/MM MD模拟的C=O频率及相关距离，用于光感受器AppA BLUF域溶液结构的研究分析。
文件详解
- chemical_shifts.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录优化构象下FMN（黄素单核苷酸）及相关残基的化学位移数据。
- excitation_energies.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录优化构象下FMN的激发能数据。
- Distance_H3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录优化构象下ASN-OD1（天冬酰胺侧链氧原子）与FMN-H3（FMN分子中特定氢原子）之间的距离数据。
- CO_freq_QMMM_MD.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录QM/MM分子动力学模拟中C=O键的平均频率及相关距离数据。
数据来源
论文“From crystallographic data to solution structure of photoreceptors: the case of AppA BLUF domain”
适用场景
- 光感受器分子结构研究：分析AppA BLUF域从晶体结构到溶液结构的转变机制。
- 生物分子动力学模拟验证：验证QM/MM MD模拟中C=O频率及原子距离等参数的准确性。
- 生物物理参数分析：研究FMN化学位移、激发能等参数与分子结构的关联。
- 蛋白质-辅因子相互作用研究：通过ASN-OD1与FMN-H3的距离数据，分析AppA BLUF域中残基与FMN的相互作用模式。
