SQUARE_MultiQC测序质量控制报告数据集

数据集概述

本数据集包含由SQUARE工具生成的MultiQC质量控制报告,涵盖大肠杆菌(E. coli)、屎肠球菌(E. faecium)和金黄色葡萄球菌(S. aureus)三种微生物的测序数据,测序平台包括Illumina公司的HiSeq(HS)、MiSeq(MS)和NextSeq(NX)。

文件详解

  • 文件列表:均为HTML格式的质量控制报告文件
  • Ecoli_HS_MQC_Report.html:大肠杆菌HiSeq平台测序数据的MultiQC报告
  • Sau_HS_MQC_Report.html:金黄色葡萄球菌HiSeq平台测序数据的MultiQC报告
  • Efcm_NX_MQC_Report.html:屎肠球菌NextSeq平台测序数据的MultiQC报告
  • Efcm_MS_MQC_Report.html:屎肠球菌MiSeq平台测序数据的MultiQC报告
  • Efcm_HS_MQC_Report.html:屎肠球菌HiSeq平台测序数据的MultiQC报告

适用场景

  • 微生物基因组测序质量评估:分析不同测序平台对三种致病菌测序数据的质量影响
  • 测序平台性能比较:对比HiSeq、MiSeq、NextSeq在微生物测序中的质量控制指标差异
  • 生物信息学质控流程验证:作为SQUARE工具生成MultiQC报告的实例数据,用于质控流程的复现与验证
  • 致病菌测序数据预处理参考:为大肠杆菌、屎肠球菌和金黄色葡萄球菌的测序数据分析提供质控基准
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 6.06 MiB
最后更新 2025年12月22日
创建于 2025年12月22日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。