数据集概述
本数据集聚焦苏必利尔湖鳟鱼四种生态型的形态与基因组分化平行性研究，包含486个个体的6822个过滤SNP基因数据及多采样点形态测量数据，覆盖Isle Royale、Big Reef等4个采样点，用于分析生态型间遗传分化、形态差异及适应性选择位点，支持进化生物学中生态物种形成机制的研究。
文件详解
- 样本信息文件
- 文件名称：sample_information.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：推测包含486个湖鳟鱼个体的采样点、编号、生态型等基础信息
- 形态测量文件（TPS格式，共8个）
- 文件名称：如Isle_Royale_144indv_head.TPS、Big_Reef_104indv_body.TPS等
- 文件格式：TPS
- 字段映射介绍：记录不同采样点（Isle Royale、Big Reef、Stannard Rock、Superior Shoals）湖鳟鱼个体的头部/身体形态测量数据，每个文件对应特定采样点的104-144个个体
- 基因组数据文件
- 文件名称：data_6822filtered_snp_486indv_4pop.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：包含4个种群486个个体的6822个过滤SNP基因分型数据，用于分析遗传分化与选择位点
数据来源
论文“Investigating the extent of parallelism in morphological and genomic divergence among lake trout ecotypes in Lake Superior”
适用场景
- 进化生物学研究：分析湖鳟鱼生态型间形态与基因组分化的平行性，探究生态物种形成机制
- 种群遗传学分析：利用VCF文件计算种群间遗传分化指数（如FST），研究基因流与遗传结构
- 适应性进化研究：筛选与脂质代谢、视觉敏锐度相关的选择位点，解析生态型适应性分化的分子机制
- 形态生态学分析：通过TPS文件比较不同生态型湖鳟鱼的形态差异，关联形态特征与生态位适应
- 保护生物学应用：评估湖鳟鱼生态型的遗传独特性，为物种保护与管理提供数据支持
