数据集概述
本数据集为论文“Using eDNA tools to examine the impact of kelp farming on underlying sediments”的补充数据与代码，包含33个文件，涉及海带养殖区沉积物的eDNA元数据、相关性分析结果、碳计算数据、dPCR数据及分析代码等，用于支持海带养殖对底层沉积物影响的研究。
文件详解
- 数据文件（.csv/.xlsx/.rds）
- 元数据文件：如
dada2_metadata_ci21_16SV4V5.csv，格式.csv，包含Sample_name（样本名）、Type（类型）、Depth（深度）、dCOI_g_ds（COI基因浓度）、TOC_percent（总有机碳百分比）等字段
- 相关性分析文件：如
COI_Correlation Analysis_16S_CI2022.csv，格式.csv，包含Treatment（处理组）、X（物种）、Y（变量）、rho（相关系数）、p（p值）等字段
- 碳计算文件：如
TBI 2021 Integrated Kelp Carbon Calculations.xlsx，格式.xlsx，记录海带碳计算相关数据
- 测序对象文件：如
EX_ps_clean_16S_phyloseq_object_CI21.RDS，格式.rds，为16S/18S测序的phyloseq对象
- 配置文件（.yaml）
- 如
dada2_config file_CI2021_ci21_16S_preprocess.yaml，格式.yaml，共8个，为dada2分析的配置文件
- 代码与文档文件（.txt）
Chebeague Island Manuscript Code.txt：格式.txt，为论文分析代码Chebeague Island Manuscript Statistical Analyses Output.txt：格式.txt，为统计分析输出结果
数据来源
论文"Using eDNA tools to examine the impact of kelp farming on underlying sediments"
适用场景
- 海洋生态影响评估：分析海带养殖对底层沉积物微生物群落及碳氮循环的影响
- eDNA技术应用研究：验证eDNA工具在海洋养殖生态监测中的有效性
- 微生物群落相关性分析：通过COI与16S/18S数据研究物种间相关性
- 碳循环研究：利用TOC、TC等数据探究海带养殖区沉积物碳储存特征
- 海洋环境监测：为海带养殖区沉积物环境质量监测提供数据支持
