TAILVAR终止密码子分析与延长变体预测数据集

数据集概述

该数据集包含TAILVAR评分开发的相关文件,TAILVAR评分用于评估终止密码子(TAA、TGA、TAG)处终止缺失变体的功能影响。TAILVAR基于随机森林模型预测终止缺失变体的致病性,整合多种预测评分、转录本特征和蛋白质上下文信息,输出0-1的致病性概率评分。

文件详解

  • TAILVAR_score_1bp_all.hg38.vcf.gz:VCF压缩文件,可能包含基于hg38基因组版本的1bp终止缺失变体TAILVAR评分数据
  • TAILVAR_score_1bp_all.hg38.vcf.gz.tbi:TBI索引文件,为对应VCF.gz文件提供索引,支持快速数据检索
  • TAILVAR_dataset_v1.1.0.zip:ZIP压缩包,可能包含TAILVAR模型开发所用的数据集版本1.1.0

适用场景

  • 基因组学研究:分析终止密码子处终止缺失变体的功能影响与致病性
  • 生物信息学模型验证:验证TAILVAR模型在预测终止缺失变体致病性中的性能
  • 变异解读应用:辅助临床或科研中对终止缺失变异的致病性评估
  • 转录组与蛋白质组关联分析:探究转录本特征、蛋白质上下文与变异致病性的关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 198.57 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。