数据集概述
本数据集包含社会性寄生蚜虫Tamalia inquilinus起源与遗传分化研究的相关文件,涉及基因序列、系统发育树、表达分析结果等内容,支持对该蚜虫与宿主的进化关系、种群结构及宿主植物关联分化的研究,共10个文件。
文件详解
- 系统发育树文件(.tre格式,共4个)
- 文件名称:RAxML_bestTree.nuclear3.reduced.tre、Groel_bayes.nex.con.tre、RAxML_bestTree.Groel.tre、nuclear3_bayes.nex.con.tre
- 内容说明:包含基于不同基因序列构建的最大似然法或贝叶斯法系统发育树结果
- 系统发育分析输入文件(.nex格式,共3个)
- 文件名称:nuclear3.nex、Groel.nex、pepck.nex
- 内容说明:用于系统发育分析的基因序列数据文件
- 表达与序列汇总文件(.xlsx格式,共2个)
- 文件名称:ScaffoldSummary.xlsx、GFOLD_summaryxlsx.xlsx
- 内容说明:包含基因表达分析结果及序列组装 scaffold 信息的汇总表格
- 序列文件(.fa格式,1个)
- 文件名称:SeqFirstLocus.fa
- 内容说明:包含特定基因座的核苷酸序列数据
数据来源
论文“The origin and genetic differentiation of the socially parasitic aphid Tamalia inquilinus”
适用场景
- 社会性寄生昆虫进化研究:分析Tamalia inquilinus的起源、系统发育关系及与宿主的协同进化模式
- 昆虫种群遗传分化分析:基于基因序列数据探究该蚜虫的种群结构与遗传多样性特征
- 宿主植物驱动的物种形成机制研究:验证宿主植物对昆虫及其寄生物生态分化的影响
- 昆虫-宿主植物互作功能分析:结合基因表达数据推测蚜虫与宿主植物关系的功能差异