数据集概述
本数据集聚焦无融合生殖蒲公英(Taraxacum officinale)的代际环境效应,通过亲代茉莉酸(JA)处理实验,分析子代转录组与代谢组的功能信号。采用亲代与子代JA及对照处理的全因子交叉设计,包含叶片RNA-seq基因表达、LC-MS代谢组学及总酚含量测定数据,揭示亲代环境对后代表型的影响机制。
文件详解
- 文件名称:dandelion_leaf_chemical_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含蒲公英叶片化学数据,可能涉及LC-MS代谢组学检测的代谢物含量、总酚含量测定结果,以及对应的处理组信息(亲代/子代JA处理或对照)。
- 文件名称:dandelion_transcriptome_assembly_A68.fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:无参考基因组组装的蒲公英转录组序列文件,包含通过RNA-seq数据从头组装得到的转录本序列,用于基因表达分析的参考序列。
适用场景
- 植物代际环境效应研究:分析亲代茉莉酸处理对后代表型(转录组、代谢组)的跨代影响机制。
- 植物防御信号通路研究:探究茉莉酸信号通路在蒲公英代际传递中的作用及相关分子调控网络。
- 转录组与代谢组整合分析:结合转录组序列与代谢组数据,解析蒲公英响应亲代环境胁迫的分子调控机制。
- 植物表观遗传研究:探索亲代环境处理诱导的表观遗传变化及其对后代表型的调控作用。