数据集概述
本数据集聚焦四齿鲀目鱼类（含河豚、箱鲀等），结合系统基因组学数据与古气候信息，验证伯格曼法则和科普法则在海洋鱼类中的适用性。通过整合185种现生种基因位点、210个化石与现生种解剖特征，构建时间校准系统发育树，分析体型演化与古气候的关联，共包含13个文件。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_updated.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据集标题、作者信息、文件说明等元数据，更新记录至2022年9月22日
- 数据文件（.xlsx格式，共6个）
- 文件名称：SI_Dataset_S13_Tetraodontiformes_Bodysize_TL_SL_calculations.xlsx
- 字段映射介绍：四齿鲀目鱼类体长（TL/SL）计算数据
- 文件名称：SI_Dataset_S3_Tetraodontiform_Body_Length_Fossil_Ages.xlsx
- 字段映射介绍：四齿鲀目化石体长与年代数据
- 文件名称：SI_Dataset_S10_BOLD_matches_COI_gene.xlsx
- 字段映射介绍：COI基因BOLD匹配数据
- 文件名称：SI_Dataset_S9_Volume_surface_area_data_CT_scans.xlsx
- 字段映射介绍：CT扫描的体积与表面积数据
- 系统发育树文件（.tre/.contree格式，共6个）
- 文件名称：SI_Dataset_S7_IQTREE_under_65__missing.contree等
- 文件格式：TRE/CONTREE
- 字段映射介绍：包含IQTREE、MrBayes、ASTRAL等工具生成的系统发育树，含时间校准、bootstrap验证等信息
- 压缩文件
- 文件名称：SI_Dataset_S4_Individual_gene_trees_1103_IQTREE_parts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：1103个基因位点的IQTREE单个基因树压缩包
数据来源
论文“The impact of paleoclimatic changes on body size evolution in marine fishes”
适用场景
- 海洋鱼类演化研究：分析四齿鲀目体型演化规律与古气候的关联
- 进化生物学法则验证：在海洋鱼类中验证伯格曼法则（温度与体型）和科普法则（演化时间与体型）
- 系统发育分析：利用时间校准系统发育树开展比较演化研究
- 古气候与生物演化关联分析：探究海洋温度变化对鱼类体型的驱动作用
- 海洋生态适应性研究：对比现生种与化石种体型差异，分析生态适应性机制
