找到21个数据集

标签: ASTRAL

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  • ASTRAL_Source_基因组规模物种树估计数据集

    2026年1月31日 30 28 5

    数据集概述 本数据集为ASTRAL方法(一种基于多物种溯祖模型的基因组规模物种树估计方法)相关的研究数据,包含模拟与生物学数据集,用于支持物种树估计的准确性验证与方法比较,共6个文件,涵盖说明文档、真实树、模拟脚本、序列数据、估计基因树及生物学数据等类型。 文件详解 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • Salmo_ischchan_塞凡湖鳟鱼基因组进化研究数据

    2026年1月30日 30 3 2

    数据集概述 本数据集为塞凡湖鳟鱼(Salmo ischchan)物种群进化研究的基因组数据,包含6个文件,涵盖线粒体DNA多序列比对、核基因SNP数据、进化分析相关的数据文件及说明文档,支持系统发育树构建、群体结构分析、基因流检测等进化生物学研究,助力解析塞凡湖鳟鱼物种群的形成机制与进化历史。 文件详解 核基因SNP数据文件...
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  • Marmosops_Based新热带区鼠负鼠亚属物种边界研究数据

    2026年1月28日 30 126 89

    数据集概述 本数据集围绕新热带区鼠负鼠亚属Marmosops的物种边界研究,包含多基因位点(12个核基因座、1个线粒体基因座)的遗传数据及物种界定分析结果,用于验证13个隐存线粒体单倍型类群的进化独立性,为该类群的分类修订提供依据。 文件详解 1.Data.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:包含研究使用的多基因位点原始数据...
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  • Fissidens_Based_凤尾藓属标本形态特征与DNA序列数据集

    2026年1月26日 30 196 2

    数据集概述 本数据集包含凤尾藓属(Fissidens)苔藓植物标本的形态特征数据及DNA序列数据,其中DNA序列通过Sanger测序和靶标捕获方法生成。数据用于检验形态特征与微生境变化的关系,支持系统发育树构建、亚属/组单系性验证、祖先特征重建及形态特征与生境湿度的系统发育相关性分析。 文件详解 说明文档与配置文件(TXT格式)...
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  • Gesneriaceae_Based_核基因靶向捕获_系统基因组学研究数据

    2026年1月21日 30 99 35

    数据集概述 本数据集为苦苣苔科(Gesneriaceae)核基因靶向捕获的系统基因组学研究数据,包含针对该科设计的830个单拷贝基因捕获探针、参考序列、系统发育树及补充表格等7个文件,用于解析苦苣苔科的系统发育关系,支持不同分类水平的进化研究。 文件详解 描述文件 文件名称:DESCRIPTION.txt 文件格式:TXT...
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  • Syngnathiformes_Based_海龙目鱼类超保守元件系统基因组学分析数据

    2026年1月18日 30 95 88

    数据集概述 本数据集为海龙目鱼类系统基因组学研究数据,基于超保守元件(UCEs)分析海龙目鱼类的快速辐射进化关系。包含序列比对、组装文件、系统发育树、分析输出等7个文件,支持解析海龙目鱼类主要类群的系统发育关系,验证传统长吻类群单系性及基部快速辐射假说。 文件详解 AccessionInfo.txt 文件格式:TXT...
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  • Tetraodontiform_Based_海洋鱼类体型演化与古气候关联研究数据

    2026年1月15日 30 95 30

    数据集概述 本数据集聚焦四齿鲀目鱼类(含河豚、箱鲀等),结合系统基因组学数据与古气候信息,验证伯格曼法则和科普法则在海洋鱼类中的适用性。通过整合185种现生种基因位点、210个化石与现生种解剖特征,构建时间校准系统发育树,分析体型演化与古气候的关联,共包含13个文件。 文件详解 文档文件 文件名称:README_updated.txt 文件格式:TXT...
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  • Syngnatharia_Based鱼类系统基因组学与历史生物地理学研究补充材料

    2026年1月15日 30 56 0

    数据集概述 本数据集是Syngnatharia鱼类(含海马、海龙、鲂鱼等)系统基因组学与历史生物地理学研究的补充材料,包含169种鱼类的基因组数据、时间校准树、祖先分布区估计及敏感性分析结果,覆盖该类群全部10科约25%的物种多样性,用于探究生物地理推断不确定性的驱动因素。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Squamate_Phylogenomic_Based爬行动物系统发育基因组学分析数据

    2026年1月14日 30 189 147

    数据集概述 本数据集基于4178个核基因座的靶向序列捕获数据,对32种有鳞目爬行动物(蜥蜴和蛇)及5个外类群进行系统发育基因组学分析。通过串联法和物种树方法,明确蛇类在蜥蜴科中的起源位置,解决了鬣蜥类蜥蜴的争议性分类地位。数据集包含6个文件,为研究有鳞目高级分类关系提供强支持的假设。 文件详解 RAxML输入文件(TXT格式)...
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  • 鳕形目鱼类系统发育分析数据集

    2025年12月24日 30 59 57

    数据集概述 本数据集围绕鳕形目鱼类系统发育分析展开,包含系统发育重建方法验证、模型选择、分支支持度评估等相关研究材料,为解决鳕形目鱼类历史争议性亲缘关系提供数据支持。 文件详解 文档类文件(PDF格式,共15个):...
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  • 园丁鸟造亭行为平行演化系统基因组学数据集

    2025年12月23日 30 28 1

    数据集概述 本数据集围绕园丁鸟造亭行为的演化机制展开,通过系统基因组学方法构建物种树,验证单配制猫鸟分支与多配制造亭物种的亲缘关系,探讨造亭行为是祖先性状丢失还是平行演化的结果,为理解这一独特行为的起源提供数据支持。 文件详解 归档文件(.tar格式): alignments_exons.tar:包含5653个外显子位点的比对文件...
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  • 快速演化辐射超保守元件分析数据集

    2025年12月22日 30 137 1

    数据集概述 本数据集围绕超保守元件(UCEs)在快速演化辐射类群(如雉科鸟类)系统发育研究中的应用展开,包含相关分析数据、补充文件及代码,用于评估多物种溯祖方法的性能,为解决复杂演化关系提供数据支持。 文件详解 补充文件(PDF格式,共10个):如Supplementary File S1-S9、Figure...
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  • fairy_wrasses进化辐射的系统基因组学分析补充材料

    2025年12月21日 30 22 7

    数据集概述 该数据集为fairy wrasses(Teleostei: Labridae: Cirrhilabrus)进化辐射的系统基因组学分析补充材料,包含基因树、系统发育树、矩阵文件、电子补充材料文档等29个文件,用于支持相关研究的结果验证与深入分析。 文件详解 基因树与系统发育树文件:...
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  • 地松鼠快速辐射类群系统发育分辨率研究数据集

    2025年12月20日 30 66 27

    数据集概述 本数据集围绕旱獭族地松鼠快速辐射类群的系统发育分辨率展开,通过3950余个超保守元件(UCE)位点,评估4种不同推断方法(RAxML、ASTRAL、NJst、SVDquartets)对系统发育估计的敏感性,以及不同过滤场景下的拓扑结构和支持度差异。 文件详解 文档与说明文件: README.txt:...
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  • 中美洲热带雨林近期局域超级多样化数据集

    2025年12月18日 30 130 113

    数据集概述 本数据集包含中美洲热带雨林近期局域超级多样化研究相关的系统发育树文件、多样化分析脚本及输入数据,支持复现研究中的谱系时间树(LTT)图和地史物种形成-灭绝分析(GeoSSE)等结果,为相关演化研究提供数据基础。 文件详解 该数据集包含7个独立文件,具体说明如下: - 系统发育树文件(.tre格式,共4个): -...
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  • 鸟类系统发育基因组数据类型与分类单元采样影响研究数据集

    2025年12月15日 30 70 38

    数据集概述 本数据集围绕鸟类系统发育基因组学研究展开,聚焦新鸟亚纲早期分化节点的系统发育树冲突问题,通过构建含90%非编码序列的235种鸟类数据矩阵,对比分析数据类型、分类单元数量及位点数量对系统发育树拓扑结构的影响,揭示数据类型为导致树结构不一致的关键因素。 文件详解 压缩文件(.gz格式):...
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  • Phengodidae甲虫系统基因组学分支支持度统计表

    2025年12月13日 30 33 12

    数据集概述 本数据集为Phengodidae甲虫系统基因组学研究中的分支支持度统计表,基于完整性为百分之四十五的核苷酸数据集,记录不同系统发育重建方法(最大似然法、贝叶斯推断、ASTRAL)下的分支统计支持值,用于验证分类关系的可靠性。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 内容说明: 表格包含不同分析方法(ML-45...
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  • 澳大利亚蜥蜴基因树不确定性与物种树推断数据集

    2025年12月10日 30 173 101

    数据集概述 该数据集围绕澳大利亚蜥蜴属(Cryptoblepharus)的系统发育研究,通过筛选约2000个外显子基因座,分析基因树分辨率对基于合并模型的物种树推断的影响,探索拓扑结构和支持度变化,为基因组数据的系统发育分析方法优化提供依据。 文件详解 压缩文件(.gz格式):...
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  • 鳉形目鱼类系统发育关系锚定杂交富集数据研究数据集

    2025年12月9日 30 178 31

    数据集概述 本数据集围绕鳉形目(Cyprinodontoidea)鱼类的系统发育关系展开,通过锚定杂交富集技术获取数据,包含16个科107个类群的遗传信息,涉及序列比对、系统发育树构建及统计分析结果,为该类群进化关系研究提供支持。 文件详解 序列比对与预处理文件:...
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  • 古柯起源基因组学研究数据集

    2025年12月8日 30 83 56

    数据集概述 本数据集基于自然历史馆藏基因组数据,探究古柯(含四种栽培品种)的地理起源与遗传多样性,通过系统发育分析验证其源自野生种Erythroxylum gracilipes的多次独立驯化假说,为理解这一经济与文化重要作物的驯化历史提供支撑。 文件详解 系统发育分析文件(.nex格式,共9个):...
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