数据集概述
本数据集围绕四齿鲀形目鱼类的时间校准系统发育分析展开,对比了节点年代校准(BEAST、MrBayes、DPPDiv)与化石端点年代校准(MrBayes、BEAST)两种主流方法。涵盖131个类群(95现存+36化石种)的16个基因位点及210个形态特征数据,为该类群系统发育研究提供多方法校准的实证数据支撑。
文件详解
- 文件名称:Supplementary_Files.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:补充文件文档,包含研究相关的补充说明、方法细节或结果补充内容
- 文件名称:Appendix1_GenBank_Accession_Numbers.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基因库登录号附录表,记录分析所用16个分子位点的GenBank accession numbers信息
- 文件名称:Trees_TD_ND.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:系统发育树文件,包含端点年代校准(TD)与节点年代校准(ND)方法生成的时间校准系统发育树数据
- 文件名称:MrBayes_TD_Commands.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:MrBayes端点年代校准命令文件,记录使用MrBayes软件进行化石端点年代校准分析的参数设置与执行命令
- 文件名称:MrBayes_ND_Commands.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:MrBayes节点年代校准命令文件,记录使用MrBayes软件进行节点年代校准分析的参数设置与执行命令
数据来源
论文“An evaluation of fossil tip-dating versus node-age calibrations in tetraodontiform fishes (Teleostei: Percomorphaceae)”
适用场景
- 分子系统发育校准方法评估: 对比节点年代校准与化石端点年代校准方法在四齿鲀形目鱼类中的应用效果
- 四齿鲀形目系统发育研究: 利用时间校准系统发育树数据开展类群起源时间、演化关系分析
- 化石数据整合方法研究: 探索化石端点年代校准方法中化石数量、位置对结果精度的影响机制
- 分子钟模型参数优化: 基于MrBayes命令文件分析不同校准方法下的分子钟模型参数设置逻辑
- 生物演化时间尺度推断: 验证不同校准方法对类群起源时间(如侏罗纪vs白垩纪)的推断差异及合理性