数据集概述
本数据集是天然通道视紫红质（ChRs）的目录资源，包含原始列表与更新列表两个核心Excel文件，以及AlphaFold3预测的结构压缩包。数据覆盖序列信息、分类归属、功能活性等维度，为通道视紫红质的研究提供系统性参考。
文件详解
该数据集包含3个核心文件，具体说明如下：
- 原始列表文件:
- 文件名称: Channelrhodopsins_Original_List.xlsx
- 文件格式: Excel (.xlsx)
- 核心字段: ID、序列名称、是否为外群（非ChR）、基因符号、物种、分类群、ChR类群、生物项目、序列来源、活性、参考文献、聚类信息、完整蛋白质序列等
- 更新列表文件:
- 文件名称: Channelrhodopsins_Updated_List.xlsx
- 文件格式: Excel (.xlsx)
- 包含3个工作表:
- full_channelrhodopsins: 完整ChR序列
- fragmented_channelrhodopsins: 视紫红质结构域不完整的ChR序列
- not_channelrhodopsins: 非ChR家族的相关蛋白质
- 核心字段: ID、序列名称、版本、审核状态、构建体、基因符号、物种、分类群、ChR类群/超类群、生物项目、序列来源、功能活性、光谱数据、氨基酸序列等
- 结构文件压缩包:
- 文件名称: Channelrhodopsins_Alphafold3_structures.zip
- 文件格式: 压缩包 (.zip)
- 内容: 所有具有完整视紫红质结构域的ChRs与视黄醛结合的AlphaFold3原始结构预测文件
适用场景
- 分子生物学研究: 分析通道视紫红质的序列特征、分类归属及进化关系
- 神经科学研究: 筛选具有特定功能（如阳离子/阴离子选择性）的通道视紫红质作为光遗传学工具
- 结构生物学研究: 基于AlphaFold3预测结构探究通道视紫红质的三维构象与功能机制
- 生物信息学分析: 构建通道视紫红质的参考数据库，支撑序列比对、聚类分析等算法开发
- 合成生物学研究: 挖掘具有潜在应用价值的天然通道视紫红质资源
