Timema_project_孤雌生殖进化分析中间数据

数据集概述

本数据集包含Timema竹节虫孤雌生殖进化分析过程中产生的关键中间文件,涵盖基因序列、进化树、直系同源群压缩包及格式化文本等类型,共七个文件,用于支持昆虫孤雌生殖进化机制的研究。

文件详解

  • 基因序列文件(.fasta格式)
  • 文件名称:trimmed_onesp_COIseqs_def.fasta、all_COIseqs.fasta
  • 字段映射介绍:包含COI基因序列数据,用于物种鉴定及进化分析
  • 进化树文件(.trees格式)
  • 文件名称:extracted_1000_singlesp.trees、extracted_1000_allCOI.trees
  • 字段映射介绍:存储基于基因序列构建的进化树数据,反映物种或基因的进化关系
  • 压缩包文件(.zip格式)
  • 文件名称:discoorthogroups_aa.zip、discoorthogroups_nu.zip
  • 字段映射介绍:包含直系同源群数据压缩包,分别存储氨基酸序列(aa)和核苷酸序列(nu)的直系同源群信息
  • 格式化文本文件(.txt格式)
  • 文件名称:OMA_formatted.txt
  • 字段映射介绍:包含GO术语编号(如GO:0003676)等功能注释信息,用于基因功能分析

适用场景

  • 昆虫进化机制研究:分析Timema竹节虫孤雌生殖的分子进化过程
  • 基因序列分析:利用COI基因序列开展物种分类及种群遗传研究
  • 直系同源群分析:通过压缩包中的直系同源群数据探究基因家族进化
  • 基因功能注释:基于OMA_formatted.txt中的GO术语开展基因功能富集分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 153.62 MiB
最后更新 2026年1月31日
创建于 2026年1月31日
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