数据集概述
本数据集围绕桃（Prunus persica）中的TIR-NB-LRR（TNL）基因家族展开，重点分析其C端后LRR（PL）结构域的特征。包含桃基因组中TNL基因的预测、PL域的序列比对、系统发育树构建等相关数据，共6个文件，支持植物抗病基因功能及结构域进化研究。
文件详解
- 文件名称：PJ2 predictions Fgenesh.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含基于Fgenesh工具预测的桃TNL基因相关数据，可能涉及基因结构、编码序列等预测结果
- 文件名称：PJ3 Muscle Alignement gene-predictedmRNA v2.0.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：基于桃v2.0基因组注释的预测mRNA序列的Muscle比对结果，支持基因序列相似性分析
- 文件名称：PJ1 seqPLalignement final.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：桃TNL基因PL结构域的最终序列比对文件，为FASTA格式的多序列比对结果
- 文件名称：TNL sequences in peach.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：桃基因组中所有预测TNL基因的序列数据，包含基因编码区、结构域等相关序列
- 文件名称：PJ4 PLsequences alignement for Tree.meg
- 文件格式：MEG
- 字段映射介绍：用于构建系统发育树的PL结构域序列比对文件，适配MEGA软件分析
- 文件名称：PJ5 Phylogenic tree of PL.nwk
- 文件格式：NWK
- 字段映射介绍：桃TNL基因PL结构域的系统发育树文件，为Newick格式的进化关系树
适用场景
- 植物抗病基因家族分析: 研究桃TNL基因的数量、分布及结构特征，解析多年生植物抗病基因家族的进化规律
- PL结构域功能研究: 基于PL域序列比对和系统发育树，探索TNL基因C端PL结构域的功能及进化起源
- 基因组注释优化: 利用TNL基因预测数据完善桃基因组的抗病基因注释，辅助Gbrowse工具的基因可视化
- 跨物种基因检测: 基于PL结构域特征基序，开发双子叶植物TNL基因的高效检测工具
- 植物免疫机制研究: 分析Ma基因多PL域结构的特异性，探究其在根结线虫抗性中的作用机制
