数据集概述
本数据集围绕象鼻虫属Trigonopterus跨Wallace线的生物地理学研究展开,包含基于303个物种的系统发育分析、生活方式转变及分布模式的相关数据,涉及系统发育树、基因超矩阵、栖息地数据等10个文件,用于探究该属跨Wallace线的扩散事件及生态适应机制。
文件详解
- 基因超矩阵文件
- 文件名称:Sula_smatrix.307.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含所有用于分析的基因序列编译而成的超矩阵
- 系统发育分析文件
- 文件名称:Sula_iqtree.307.bs.nex、Sula_iqtree.307.bt.nwk、Sula_beast.307.xml、Sula_beast.307.nwk、Sula_beast.303.bdu.nwk
- 文件格式:NEX、NWK、XML
- 字段映射介绍:涵盖IQ-TREE分析使用的模型方案、最优树结果,BEAST分析的XML输入文件、最大类群置信度(MCC)树及排除外类群的MCC树
- 栖息地分析文件
- 文件名称:Sula_habitat.303.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:为Simmap分析准备的Trigonopterus栖息地数据
- 压缩包文件
- 文件名称:BioGeoBEARS.zip、Simmap.zip、phylANOVA.zip、HiSSE.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含生物地理学分析(BioGeoBEARS)、栖息地转变分析(Simmap)、系统发育方差分析(phylANOVA)及性状进化分析(HiSSE)相关数据
- 说明文件
- 文件名称:README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集内容说明文档
适用场景
- 生物地理学研究:分析Trigonopterus属象鼻虫跨Wallace线的扩散事件及方向
- 进化生态研究:探究跨Wallace线后象鼻虫生活方式(从 foliage到leaf litter)的转变机制
- 系统发育分析应用:验证IQ-TREE和BEAST等方法在物种进化关系推断中的效果
- 生态适应机制研究:结合栖息地数据和系统发育树,分析气候、捕食者 fauna等因素对物种栖息地选择的影响