Tursiops_Based宽吻海豚北大西洋后冰川期殖民化基因研究数据

数据集概述

本数据集为宽吻海豚后冰川期殖民化研究相关的基因数据,包含基因序列文件和进化分析输入文件,用于重建东北大西洋宽吻海豚的殖民化历史,探究冰期对当代种群遗传结构与多样性的影响。数据集共5个文件,涵盖海豚基因序列拼接、比对及进化分析模型输入等内容。

文件详解

  • 基因序列文件(.fas格式)
  • 文件名称:Delphinids_SABD1_SA99_gene_regions_concatenated.fas、Tursiops_gene_regions_concatenated.fas、Tursiops_Steno_bredanensis_aligned_whole_mtDNA.fas
  • 文件格式:FAS
  • 字段映射介绍:包含海豚科(Delphinids)、宽吻海豚(Tursiops)及其他相关物种的基因区域拼接序列、全线粒体DNA比对序列,记录基因序列的碱基排列信息
  • 进化分析输入文件(.xml格式)
  • 文件名称:StarBEAST2_Tursiops_input_3rd_codons.xml、BEAST2_Delphinid_Strict_clock_3rd_codons.xml
  • 文件格式:XML
  • 字段映射介绍:StarBEAST2和BEAST2进化分析工具的输入文件,包含以第三密码子为基础的进化模型参数设置,用于构建时间校准的系统发育树

适用场景

  • 海洋生物进化历史研究:通过基因序列数据重建宽吻海豚东北大西洋殖民化过程,分析冰期对种群扩张的影响
  • 种群遗传结构分析:探究宽吻海豚沿海与远洋种群的遗传多样性差异及母系谱系来源
  • 进化模型验证:利用XML输入文件测试不同进化时钟模型在海豚科物种基因分析中的适用性
  • 冰期生态响应研究:结合基因数据与栖息地模型,分析晚更新世冰川循环对海洋生物分布的遗留效应
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.71 MiB
最后更新 2026年1月26日
创建于 2026年1月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。