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标签: 基因比对

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  • 热带气候下基因组复制的重复迁移研究数据

    2026年2月9日 30 76 35

    数据集概述 本数据集为论文“Repeated shifts out of tropical climates preceded by whole genome duplication”的配套分析数据,包含研究所需的输入数据、输出结果及分析脚本,共6个文件,涵盖转录组、叶绿体、生物气候与生活史数据库等内容,支持植物进化相关分析。 文件详解...
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  • 羊肚菌科真菌中新型木材腐朽机制的基因组进化研究数据

    2026年1月31日 30 174 152

    数据集概述 本数据集包含Agaricales目真菌Fistulina hepatica和Cylindrobasidium torrendii的基因组序列,结合比较基因组学与木材腐朽实验,研究新型木材腐朽机制的演化。数据挑战传统白腐与褐腐二分法,揭示部分真菌的中间型腐朽特征及演化过程,共含6个压缩文件。 文件详解...
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  • Tryblionella_Based_基因比对与AU测试结果数据集

    2026年1月27日 30 103 14

    数据集概述 本数据集包含Tryblionella属生物的基因比对相关文件,涵盖基因序列比对数据、GenBank ID信息及AU测试结果,共6个文件,涉及.xlsx、.fas、.txt三种格式,用于生物信息学领域的基因序列分析与实验测试。 文件详解 Excel文件(.xlsx格式,共2个) 文件名称:genbank ID...
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  • Tursiops_Based宽吻海豚北大西洋后冰川期殖民化基因研究数据

    2026年1月26日 30 141 106

    数据集概述 本数据集为宽吻海豚后冰川期殖民化研究相关的基因数据,包含基因序列文件和进化分析输入文件,用于重建东北大西洋宽吻海豚的殖民化历史,探究冰期对当代种群遗传结构与多样性的影响。数据集共5个文件,涵盖海豚基因序列拼接、比对及进化分析模型输入等内容。 文件详解 基因序列文件(.fas格式)...
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  • Katz_Grant_Based_真核生物系统发育基因组分析及子采样研究数据

    2026年1月20日 30 86 14

    数据集概述 本数据集来自真核生物系统发育基因组分析研究,包含232种真核生物、486种细菌和84种古菌的基因组数据,涉及1554个垂直遗传基因。数据支持五大真核生物分支(变形虫界、 excavata、后鞭毛生物、原始色素体生物、SAR超类群)的关系解析,分析了内共生基因转移(EGT)对系统发育的影响,并验证了位点抽样在系统发育分析中的优势。 文件详解...
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  • Sadier_et_al_Based_新热带蝙蝠视蛋白损失多因素进化研究数据

    2026年1月20日 30 187 155

    数据集概述 本数据集围绕新热带蝙蝠视蛋白损失的多因素进化过程展开,包含视蛋白基因序列、转录本及蛋白质相关数据,用于研究蝙蝠视觉表型损失中的转录与转录后调控机制,揭示基因型与表型的复杂关系,共含5个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称:README_for_Sadier_et_al_Opsins.txt 文件格式:TXT...
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  • OGRDB_打开小鼠种系基因组数据库_BALB_c小鼠IGH受体种系参考数据集

    2026年1月19日 30 74 39

    数据集概述 本数据集为小鼠BALB/c亚群的IGH受体种系参考集,由Open Germline Receptor Database(OGRDB)发布。包含IGH受体基因的种系序列数据及相关说明文件,共4个文件,支持免疫遗传学领域对小鼠BALB/c亚群IGH受体基因的研究与分析。 文件详解 许可文件: 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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  • Schneider_2020_Ochnaceae科核基因靶向富集系统基因组学研究数据

    2026年1月18日 30 56 12

    数据集概述 本数据集包含Ochnaceae科植物的DNA序列比对文件,涵盖单个基因比对和所有基因串联比对结果,以及用于核基因靶向富集的探针序列诱饵集。数据支撑相关论文中的系统发育分析,涉及超过250个分类群,共6个文件。 文件详解 串联比对文件...
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  • NCBI_Based_公共DNA数据库标本级分析工具包与Carex属数据_2016修订版

    2026年1月13日 30 135 43

    数据集概述 本数据集包含基于NCBI GenBank等公共DNA数据库开发的标本级分析工具包及应用案例数据,核心为Carex属(莎草科)的多基因序列分析结果,含基因比对文件、矩阵文件及分析工具代码,可支持物种一致性检验与最优序列筛选,是生物多样性研究中标本级数据分析的工具参考与数据示例。 文件详解...
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  • ENA_PRJEB62664_Symphonia_globulifera全基因组组装与注释数据

    2026年1月12日 30 199 159

    数据集概述 本数据集包含热带雨林物种Symphonia globulifera的从头组装核基因组、叶绿体基因组及线粒体基因组相关数据,涉及基因组组装、注释、编码序列提取及基因比对结果,可用于研究该物种的种内遗传变异特性,共包含7个文件。 文件详解...
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  • echinoderms_Mitogenomes_替代起始密码子和谱系特异性基因顺序保守性研究数据

    2026年1月8日 30 55 16

    数据集概述 本数据集包含echinoderms(棘皮动物)有丝分裂基因组研究相关的数据,涵盖样本信息、基因比对结果及串联矩阵,共17个文件。主要用于揭示棘皮动物有丝分裂基因组中的替代起始密码子特征及谱系特异性基因顺序的保守性,为生物基因研究提供支持。 文件详解 基因比对文件(.fasta格式,共16个)...
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  • Arcobacter_butzleri_Genomic_Diversity_Analysis_Data

    2026年1月3日 30 90 73

    数据集概述 本数据集包含对49株Arcobacter butzleri基因组的分析结果,涵盖基因组组装与注释、核心及泛基因组位点数据。数据支持研究该新兴人类病原体的毒力、抗生素耐药性可塑性及基因组多样性,包含组装序列、转录本序列、氨基酸序列、核心基因座比对、特定基因比对、PorA高变区分类序列及泛基因组等位基因谱矩阵等8个文件。 文件详解...
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  • 竹类植物形态与分子证据补充材料数据集2025

    2025年12月19日 30 136 118

    数据集概述 本数据集是关于竹类植物Indosasa gigantea和Acidosasa glauca的形态与分子证据补充材料,包含用于构建ASTRAL物种树的单拷贝同源基因比对数据及相关补充表格,支持两物种为同种的研究结论。 文件详解 文件名称: oo_1314266.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip) 文件内容:...
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  • 濒危哈特尔水蛇的真圆线虫属感染研究数据集

    2025年12月11日 30 87 82

    数据集概述 该数据集为研究论文配套数据,包含濒危物种哈特尔水蛇(Nerodia harteri)感染真圆线虫属(Eustrongylides sp.)的相关数据、R语言分析文档及基因序列比对文件,支持对该寄生感染的深入研究。 文件详解...
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  • RNA测序工作流文件数据集

    2025年12月15日 30 3 2

    数据集概述 本数据集是ddbj/workflow-registry的工作流之一,包含150个文件,以.nf格式文件为主,涵盖RNA测序分析相关的流程模块、配置文件、脚本文件及辅助资源,用于支撑RNA测序数据处理流程的执行与配置。 文件详解 核心流程模块文件(.nf格式,共70个) 示例文件:modules_nf-...
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  • 中国南部环节动物门龙介科新物种Notomastus系统发育分析DNA序列及GenBank登录号表

    2025年12月14日 30 158 3

    数据集概述 本数据集为学术论文中的表格数据,记录了用于Notomastus属新物种系统发育分析的DNA序列及对应GenBank登录号,涵盖中国南部新物种及其他地区近缘物种的18S、H3基因序列信息,支持环节动物分类学研究。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射: 包含物种名称(Species...
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  • 亚马逊河微生物降解陆地有机物的宏基因组与群体基因组学研究论文附录数据集

    2025年12月12日 30 96 82

    数据集概述 本数据集是论文《亚马逊河微生物降解陆地有机物的宏基因组与群体基因组学研究》的补充材料,包含12个附录文件,均为PDF格式,涵盖基因比对、蛋白质家族分析、宏基因组NMDS分析等研究细节,支撑论文核心研究结论。 文件详解 该数据集包含12个PDF格式的附录文件,具体说明如下: -...
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  • Halamphora_witkowskii比对与系统发育树数据集

    2025年12月6日 30 9 7

    数据集概述 本数据集围绕Halamphora witkowskii的序列比对与系统发育树展开,包含序列信息、系统发育树可视化及基因比对数据,为研究该物种的分子系统发育关系提供基础数据支持。 文件详解 List of sequences with corresponding accession numbers.xlsx:...
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  • Halamphora_lukasiewiczii_Based_藻类基因比对分析完整数据

    2025年12月4日 30 182 174

    数据集概述 该数据集包含Halamphora lukasiewiczii相关的基因比对数据文件,涵盖序列信息、系统发育树及基因比对结果三类文件,为研究该生物的基因特征与系统发育关系提供数据支持。 文件详解 List of sequences with corresponding accession...
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  • Omolicna亚属Agoo修订种18S基因成对比较数据集

    2025年12月4日 30 177 126

    数据集概述 该数据集为表格形式的18S基因成对比较数据,基于一千次自举重复和p距离法生成,包含Omolicna亚属Agoo修订种及相关物种间的基因序列差异值,支持昆虫分类学中物种亲缘关系的分析。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML(.html) 内容说明:表格包含十一行物种(如Agoo dahliana、Agoo...
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