数据集概述
本数据集为引入栽培太平洋海带Undaria pinnatifida的群体基因组学研究数据,包含码头、养殖场及自然岩礁三种栖息地种群的遗传信息。通过RAD-seq和微卫星两种方法分析,探究栖息地对种群遗传多样性、连通性及野外定殖的影响,共含2个文件。
文件详解
- Guzinski-et-al-Undaria-RADseqVCF file.vcf
- 文件格式:VCF
- 字段映射介绍:RAD-seq技术获得的基因型数据文件,包含738个个体的单核苷酸多态性(SNP)信息,用于精细遗传结构分析。
- Guzinski et al Undaria - microsatellites file.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:微卫星标记基因型数据文件,记录种群的遗传多样性、近交系数等群体遗传参数,用于对比不同栖息地种群遗传特性。
适用场景
- 海洋入侵物种研究:分析Undaria pinnatifida在不同栖息地的遗传多样性及扩散机制,为入侵物种管理提供依据。
- 群体遗传学分析:利用RAD-seq和微卫星数据,探究人类活动(如休闲 boating)对种群遗传结构的影响。
- 海洋生态保护:研究码头、养殖场与自然岩礁种群的连通性,为制定针对性的扩散控制策略提供数据支持。
- 遗传标记技术对比:比较RAD-seq与微卫星两种技术在群体遗传研究中的应用效果及分辨率差异。