数据集概述
本数据集围绕蚂蚁Temnothorax longispinosus的Vitellogenin-like A(Vg-like A)基因展开,包含基因序列比对、基因敲降实验原始数据、行为测试结果、化学分析及基因表达数据等11个文件,用于探究Vg-like A通过调控社会线索响应性影响蚂蚁行为任务分工的机制,支持昆虫社会分工分子调控机制的研究。
文件详解
- 基因序列与比对文件
- 文件名称:FINAL ALIGNMENT.clustal、Vg_Vg-like_sequences.fasta
- 文件格式:.clustal、.fasta
- 字段映射介绍:包含Vg及Vg-like基因的核苷酸或氨基酸序列,以及序列比对结果,用于系统发育分析
- 基因敲降实验原始数据
- 文件名称:Longterm knock down raw data.zip、Shortterm knock down raw data.zip、qPCR raw data.zip
- 文件格式:.zip
- 字段映射介绍:压缩包内包含长期/短期Vg-like A基因敲降实验的原始数据,以及定量PCR(qPCR)实验的原始数据,用于验证基因表达水平变化
- 行为测试结果文件
- 文件名称:Preference_test.txt、Light dark test.txt、Broodcare test.txt
- 文件格式:.txt
- 字段映射介绍:记录不同处理组(对照组、Vg-like A敲降组)蚂蚁的行为偏好测试、光暗选择测试、育幼行为测试的原始数据,包含处理组、行为指标数值等字段
- 化学分析与生理数据文件
- 文件名称:CHC_analysis.xlsx、Ovaries.txt
- 文件格式:.xlsx、.txt
- 字段映射介绍:CHC_analysis.xlsx包含蚂蚁表皮碳氢化合物(CHC)的分析数据;Ovaries.txt记录蚂蚁卵巢相关生理数据
- 其他实验数据文件
- 文件名称:Nestmate care test.txt
- 文件格式:.txt
- 字段映射介绍:记录蚂蚁巢友照顾行为测试的原始数据,包含处理组、行为指标数值等字段
数据来源
论文“Vitellogenin-like A–associated shifts in social cue responsiveness regulate behavioral task specialization in an ant”
适用场景
- 昆虫社会行为调控机制研究:分析Vg-like A基因对蚂蚁行为任务分工的调控作用
- 基因功能验证:通过基因敲降实验数据验证Vg-like A基因在蚂蚁行为转变中的功能
- 行为生态学研究:利用行为测试数据探究蚂蚁对社会线索响应性的变化规律
- 分子进化分析:基于Vg及Vg-like基因序列比对结果,研究该基因家族的进化关系
- 化学通讯机制研究:通过CHC分析数据探究蚂蚁化学通讯与行为分工的关联