Vulpes_lagopus_Based_北极狐近交基因组与适应性后果研究数据

数据集概述

本数据集聚焦濒危食肉动物北极狐的近交问题,通过组装基因组及重测序23只个体(涵盖移民事件前后出生个体),分析近交的基因组后果与适应性影响。数据包含研究所需的基因组和适应性数据、说明文档及分析代码,助力探究遗传变异与生存适应性的关联及遗传拯救的短暂性。

文件详解

  • Readme_Hasselgren_et_al._Mol_Ecol.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:研究说明文档,可能包含数据背景、样本信息、分析方法概述等内容
  • Genomic___fitness_data_Mol_Ecol.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:核心数据文件,包含基因组多样性(如杂合度、FROH值)、适应性(如第一年生存率)等关键指标数据
  • r-code_mol_ecol.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:分析代码文件,包含ROH长度线性回归、杂合度与近交分析、生存概率广义线性模型、FPED相关性检验及T检验、FROH/杂合度/FPED/ROH长度的直方图绘制等分析脚本

适用场景

  • 濒危物种保护研究:分析北极狐近交对基因组多样性及生存适应性的影响,为物种保护策略制定提供依据
  • 基因组学与适应性关联研究:探究遗传变异(如杂合度、ROH)与个体生存概率的关系
  • 遗传拯救效果评估:验证移民事件对濒危种群遗传多样性及适应性的短暂拯救作用
  • 野生动物近交后果检测:通过基因组方法检测野外种群的近交衰退现象
  • 生物信息学分析方法参考:借助分析代码,学习濒危物种基因组与适应性数据的统计分析方法
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.02 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。