数据集概述
本数据集包含支持Eriachneae族质体基因组系统发育研究及Micrairoideae亚科C4光合作用进化分析的相关数据，涵盖质体基因组序列、系统发育树、物种分布信息及补充文档，共9个文件，用于探究该类群的系统发育关系、光合途径及生境偏好。
文件详解
- 质体基因组序列文件（.fsa格式）
- 文件名称：plastomes_aligned_nogaps.fsa、plastomes_aligned_halfgaps.fsa、plastomes_aligned_allgaps.fsa、plastomes_aligned_noGblocks.fsa
- 文件格式：FSA
- 字段映射介绍：包含不同处理方式的质体基因组比对序列，分别对应无空位、半空位、全空位及未使用Gblocks过滤的比对结果
- 系统发育树文件（.tre格式）
- 文件名称：ML_tree_halfgaps.tre、ML_tree_nogaps.tre、ML_tree_allgaps.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：基于不同空位处理的质体基因组数据构建的最大似然法系统发育树
- 物种分布信息文件（.csv格式）
- 文件名称：micrairoideae_localities.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含species（物种名）、tribe（族）、decimallongitude（经度）、decimallatitude（纬度）字段，记录物种的地理分布信息
- 补充文档（.docx格式）
- 文件名称：SI.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：研究相关的补充信息文档
数据来源
论文“Plastome phylogenetics of tribe Eriachneae and evolution of C₄ photosynthesis in subfamily Micrairoideae (Poaceae)”
适用场景
- 禾本科系统发育研究: 利用质体基因组序列及系统发育树分析Eriachneae族与近缘类群的亲缘关系
- C4光合作用进化分析: 结合光合途径数据探究Micrairoideae亚科C4光合作用的起源与演化模式
- 植物生境偏好研究: 通过物种分布数据及生境分析，探讨不同族的生境适应性差异
- 质体基因组数据分析方法比较: 对比不同空位处理方式对系统发育树构建结果的影响
- 植物地理分布研究: 基于物种分布坐标分析Micrairoideae亚科物种的地理分布格局
