数据集概述
本数据集包含冬小麦MAGIC群体WM-800的单倍型块（HBs）和单倍型（HTs）数据，基于小麦15k Infinium和135k Affymetrix SNP阵列基因分型结果构建。数据涵盖SNP基因型矩阵、单倍型块与单倍型信息、遗传结构（GS）及主坐标分析（PCOs）结果，可用于小麦基因组关联分析（GWAS）及遗传多样性研究，共包含六个文件。
文件详解
- 元数据与说明文件
- 文件名称：README_file.txt、File_0__README___Meta_data.xlsx
- 文件格式：TXT、XLSX
- 字段映射介绍：包含数据集作者、标题、研究背景等元信息，说明单倍型数据的构建方法与用途。
- SNP基因型数据文件
- 文件名称：File_A__WM800__15k_135k_SNPs__ACGT-coded.xlsx、File_B__WM-800__15k_135k_SNPs__012-coded___imputed.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：分别以ACGT碱基编码和012数值编码（含插补）记录WM-800群体基于15k和135k SNP阵列的基因型数据。
- 单倍型块与单倍型数据文件
- 文件名称：File_D__WM-800__HBs__HTs___singular_SNPs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含WM-800群体的单倍型块（HBs）、单倍型（HTs）定义及对应的单一SNP信息。
- 遗传结构与主坐标分析文件
- 文件名称：File_C__WM-800__GS_and_PCOs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录WM-800群体的遗传结构（GS）和主坐标分析（PCOs）结果，用于群体遗传多样性评估。
适用场景
- 小麦基因组关联分析（GWAS）: 利用单倍型块与单倍型数据，提升复杂性状关联分析的分辨率和效率。
- 小麦遗传多样性研究: 通过遗传结构（GS）和主坐标分析（PCOs）结果，分析WM-800群体的遗传分化与多样性。
- 单倍型块构建方法验证: 评估基于SNP阵列数据构建小麦单倍型块的准确性与适用性。
- 分子标记辅助育种: 基于单倍型信息开发紧密连锁的分子标记，用于小麦重要农艺性状的辅助选择。
