数据集概述
本数据集是论文《Brachypodium distachyon开花时间变异的遗传结构》的补充数据,包含RIL群体(F7;Bd21×Bd1-1)的基因型、表型数据、遗传图谱、基因位置文件、QTL分析R脚本及目标基因的VCF文件,支持开花时间遗传机制研究。
文件详解
- 压缩包文件:Supplemental_dataset_woods_2016.zip,格式为ZIP,包含以下内容:
- Data文件夹:含原始基因型数据(RIL群体亲本基因型)、原始表型数据(不同环境下开花时间)、遗传图谱、基因位置文件(基于Brachypodium distachyon基因组V2.1)
- Final_script.R:QTL分析所用R脚本
- VCF文件夹:含Fig.6中VRN1、PHYC、VRN2、FD基因的VCF文件
数据来源
论文“GENETIC ARCHITECTURE OF FLOWERING-TIME VARIATION IN BRACHYPODIUM DISTACHYON (Woods et al., 2016)”
适用场景
- 植物遗传学研究:分析Brachypodium distachyon开花时间变异的遗传结构及QTL定位
- 作物育种应用:挖掘开花时间相关基因,为禾本科作物花期改良提供参考
- 生物信息学分析:验证QTL分析方法,或基于VCF文件开展基因序列变异研究
- 环境互作研究:结合不同环境下表型数据,探究开花时间对环境的响应机制