数据集概述
本数据集围绕物种选择机制对系统发育树形态的影响展开,包含模拟实验数据、实证分析数据及相关说明文档,支持研究动态性状依赖的物种分化过程与系统发育树特征的关联。
文件详解
- 说明文档类:
- README_for_simulation_scripts.docx:Word文档,模拟脚本说明
- README_for_habitat_scorings.txt:文本文件,栖息地评分说明
- README_for_shift_sims_by_individ_run.txt:文本文件,单运行偏移模拟说明
- README_for_shift_sims_by_param_comb_means.txt:文本文件,参数组合均值偏移模拟说明
- 数据文件类:
- phylogenetic_trees.txt:文本文件,系统发育树数据
- habitat_scorings.xlsx:Excel文件,GCFR物种栖息地关联及评分数据
- static_sims_by_param_comb_means.csv:CSV文件,静态模拟参数组合均值数据,含模型、物种形成率、灭绝率等字段
- Species_enviro_data.xlsx:Excel文件,物种环境数据
- shift_sims_by_individ_run.csv:CSV文件,单运行偏移模拟数据,含树大小、Colless指数、Gamma指数等字段
- shift_sims_by_param_comb_means.csv:CSV文件,参数组合均值偏移模拟数据
- 附录与报告类:
- Appendix_1.pdf:PDF文件,附录1
- area_reconstructions.pdf:PDF文件,区域重建报告
- 脚本归档类:
- simulation_scripts.zip:压缩文件,模拟脚本集合
适用场景
- 进化生物学研究:分析物种选择机制对系统发育树形态的影响
- 生态学分析:探究栖息地特征与物种分化的关联
- 生物信息学:验证动态性状依赖的物种分化模型
- 环境科学:研究环境变化对物种系统发育的作用
- 数据模拟方法学:优化物种分化模拟实验设计与参数分析