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弹性波隐身极值微极材料参数与有限元模拟程序补充数据集
2025年12月14日 30 204 182
数据集概述 本数据集为论文《用于弹性波隐身的极值微极材料》的补充数据，包含支持数据及相关程序，涉及微极材料参数生成、有限元模拟脚本与结果可视化图像，为论文研究提供数据支撑。 文件详解 文档文件： ReadMe.txt：文本格式，说明文件夹包含的文件类型及用途，如脚本用于生成数据或图片，依赖软件为Matlab R2023a与COMSOL...
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阿卡波糖偏好性葡萄糖苷酶催化代谢分子机制研究补充数据集
2025年12月14日 30 83 71
数据集概述 该数据集为研究论文《阿卡波糖偏好性葡萄糖苷酶催化代谢分子机制》的补充数据，包含分子动力学模拟（MD）和量子力学/分子力学（QM/MM）相关的计算数据，支持对阿卡波糖代谢分子机制的分析。 文件详解 分子结构文件（.xyz格式，10个）：如TS4.xyz、EP1.xyz、ES.xyz等，存储分子动力学模拟和QM/MM计算的坐标数据...
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氮化镓碱性湿法刻蚀的神经网络驱动分子洞察数据集
2025年12月13日 30 200 182
数据集概述 本数据集围绕氮化镓（GaN）碱性湿法刻蚀的分子机制展开，包含训练好的Behler-Parrinello型神经网络势（NNP）及相关数据，用于精准模拟镓、氮、钾、氧五元体系的相互作用与动力学过程，支持纳米结构制备的原子级精度研究。 文件详解 文件名称: dataset_extxyz.zip，文件格式:...
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分子材料激子动力学模拟脚本数据与图表
2025年12月13日 30 41 10
数据集概述 该数据集包含运行“分子材料激子动力学的形式精确、任意可扩展模拟”研究中所有计算所需的脚本、所有图表的汇总数据及绘图代码，需搭配MesoHOPS软件使用。 文件详解 文件名称: Figures_and_data.zip.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明: 包含研究中使用的计算脚本、图表汇总数据及绘图代码，需解压后使用...
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集合体伞形优化数据集
2025年12月10日 30 121 70
数据集概述 该数据集围绕“集合体伞形优化（URE）”方法展开，旨在解决分子动力学模拟中柔性蛋白质构象偏好量化的挑战。URE方法通过结合贝叶斯定理与伞形采样技术，优化构象集合参数，适用于与前向KL散度配合使用。数据集包含模拟脚本、分析设置文件及URE方法实现，以丙氨酸-丙氨酸两性离子和奇诺林肽为验证系统，支持相关模拟与分析的复现。 文件详解 文件名称:...
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物种选择机制与系统发育树形态数据集
2025年12月10日 30 1 0
数据集概述 本数据集围绕物种选择机制对系统发育树形态的影响展开，包含模拟实验数据、实证分析数据及相关说明文档，支持研究动态性状依赖的物种分化过程与系统发育树特征的关联。 文件详解 说明文档类： README_for_simulation_scripts.docx：Word文档，模拟脚本说明...
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系统发育灭绝测量偏差与二叠纪末四足动物案例研究数据集
2025年12月9日 30 51 19
数据集概述 本数据集围绕系统发育灭绝聚类测量的偏差问题展开，通过模拟研究不同进化与分析场景下的预期偏差，并以二叠纪-三叠纪大灭绝事件中的四足动物类群为案例，应用灭绝聚类的系统发育指标进行分析，包含模拟脚本、结果数据及补充图表等。 文件详解 图表文件： Figure S1.pdf、Figure S2.pdf、Figure S3.pdf、Figure...
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不对称膜力学性质与能量学直接推导数据集
2025年12月8日 30 32 27
数据集概述 本数据集包含伞形采样模拟中不对称双层膜的初始与最终快照，数据格式兼容NAMD/VMD分子动力学软件。通过直接推导其能量学特性，旨在阐明不对称膜的力学性质，为相关研究提供基础数据支持。 文件详解 分子动力学模拟脚本文件： us.namd：NAMD格式文件，可能为伞形采样模拟的主配置脚本...
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异质性_多样性关系分析数据与代码集2025
2025年12月8日 0 200 177
数据集概述 本数据集包含用于复现题为《分离离散度与均值揭示真实异质性-多样性关系》研究论文结果及图表的代码与数据。支持对异质性-多样性关系的量化分析，含模拟脚本、实证数据分析及修订后的图表生成文件。 文件详解 数据集包含一个压缩文件，具体说明如下： - 文件名称: MI-HDR_NatComm.zip - 文件格式: ZIP (.zip) -...
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ykkC_I核糖开关适配体结构域金属离子与阳离子配体相互作用分子动力学模拟数据集
2025年12月7日 30 3 1
数据集概述 本数据集为关于ykkC-I核糖开关适配体结构域的分子动力学模拟研究数据，围绕金属离子与阳离子配体相互作用展开，包含模拟参数、初始结构、主成分分析相关文件及自由能景观生成脚本等内容。 文件详解 FEL-scripts.zip：ZIP格式压缩文件，可能包含用于生成自由能景观（Free Energy Landscape）的脚本文件...
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模拟MCS降水位移对地表条件变化敏感性的数据与脚本
2025年12月6日 30 167 135
数据集概述 该数据集包含用于研究模拟中尺度对流系统（MCS）降水位移对地表条件变化敏感性的相关数据与脚本，为大气科学领域分析地表条件对降水分布影响提供支持。 文件详解 文件名称：MCS_irrigation_v5_clean_version.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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海草生态系统干扰后土壤有机碳突然损失模型代码数据集
2025年12月6日 30 197 7
数据集概述 本数据集包含用于运行海草-土壤模型分岔图和敏感性分析的代码，对应研究论文《海草生态系统干扰后土壤有机碳的突然损失》。代码按论文图表分类，便于复现模拟及可视化结果，支持对生态系统模型行为的探索。 文件详解 文件名称: abrupt_carbon_loss_seagrass_model.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容结构:...
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两步法多物种溯祖模型全似然物种树推断数据集
2025年12月4日 30 1 0
数据集概述 该数据集包含用于两步法多物种溯祖模型全似然物种树推断的模拟与分析脚本，支持基因树生成、DNA序列模拟及五种基于溯祖模型的物种树估计方法的数据分析。 文件详解 文件名称：two-step_msc.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容说明：压缩包内包含两类脚本，一是模拟脚本（生成带不完全谱系分选的基因树、基于Jukes-...
