数据集概述
本数据集包含大肠杆菌腺苷酸激酶（AdK）开放态与闭合态构象转变的平均力势（PMF）数据，基于NMP结构域、LID结构域与CORE结构域的夹角变量构建，为酶构象转变的计算方法验证提供基础数据。
文件详解
- 文件名称: free_bw2_tol1e-05.dat
- 文件格式: DAT
- 核心字段:
- NMP-core angle (degrees): NMP结构域与CORE结构域的夹角（度）
- LID-core angle (degrees): LID结构域与CORE结构域的夹角（度）
- free energy in kcal/mol: 自由能（单位：千卡/摩尔）
- 说明: 为WHAM程序输出文件，其他列可忽略
- 文件名称: AdK_apo_PMF.jpg
- 文件格式: JPG
- 说明: PMF数据经三次样条平滑后的可视化图像
适用场景
- 生物物理学研究：验证酶构象转变路径采样的计算方法
- 分子动力学模拟：作为腺苷酸激酶构象转变自由能景观的参考基准
- 计算生物学方法开发：用于评估不同构象采样算法的准确性
- 酶动力学研究：分析腺苷酸激酶铰链运动的能量特征与机制
