数据集概述
本数据集记录了栽培向日葵在早期和晚期干旱胁迫下的转录组与表型响应差异。通过常见园实验，对六个油葵品系在对照和干旱条件下的表型（如生物量、叶面积、水分利用效率）及转录组（差异表达基因、共表达模块）数据进行采集分析，揭示相似转录响应在不同生育期引发不同表型的机制。包含21个文件，涵盖基因列表、表型指标、富集分析等多类型数据。
文件详解
- 基因相关文件
- 文件名称：genelist.e.onpersist.csv、genes.e.exclusive.csv、genelist.e.recovery.csv、genelist.e.onoff.csv、genes.l.exclusive.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录不同干旱处理（早期、晚期）下的差异表达基因列表，包括持续表达、特异性表达、恢复阶段相关及开关型表达的基因ID
- 表型数据文件
- 文件名称：18HP02_shape_height.csv、18HP02_Collaboration_INRA_UGA_DUALEX.csv、dfmerge.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含向日葵株高、叶片光学特性（如叶绿素含量）等表型指标，以及多表型数据的合并结果
- 共表达与富集分析文件
- 文件名称：hubs.zip、enrichment_nes.tsv、ora.tsv、module.tsv、modules_genes.gmt、gmt.gmt
- 文件格式：ZIP、TSV、GMT
- 字段映射介绍：存储共表达网络核心基因、基因富集分析结果（如NES值、ORA分析）及共表达模块与基因的对应关系
- 其他文件
- 文件名称：README.md、name_merge.matrix
- 文件格式：MD、matrix
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据来源、版本信息；基因名称合并矩阵
适用场景
- 植物干旱响应转录机制研究: 分析不同生育期干旱胁迫下向日葵差异表达基因的功能与调控通路
- 表型-转录组关联分析: 探究相似转录响应引发不同表型（如生物量、水分利用效率）的分子机制
- 作物抗逆性育种: 筛选干旱胁迫下关键响应基因，为向日葵抗旱品种选育提供靶点
- 植物生理生态研究: 研究干旱恢复阶段向日葵的生长补偿效应及水分利用策略
- 基因共表达网络分析: 基于共表达模块解析向日葵应对干旱胁迫的分子网络调控模式
