小鼠组织单细胞表达计数数据集_Mouse_Tissue_Single_cell_Expression_Counts
数据来源:互联网公开数据
标签:单细胞测序, 基因表达, 组织特异性, 生物信息学, 细胞计数, 转录组学, 数据分析, 基因组学
数据概述:
该数据集包含来自小鼠多种组织(包括主动脉、膀胱、大脑、横膈肌、脂肪、心脏、肾脏、大肠、肢体肌肉、肝脏、肺、淋巴结、卵巢、胰腺、皮肤、小肠、脾脏、睾丸、胸腺、甲状腺、气管)的单细胞转录组数据,记录了不同组织中基因表达的细胞计数信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间信息,可视为静态数据集。
地理范围:数据来源于小鼠组织样本,不涉及地理范围。
数据维度:数据集包括21个CSV文件,每个文件对应一种组织,每个文件包含基因的表达计数,以及细胞的唯一标识符。数据包含了“Unnamed: 0”列,以及每个细胞的基因表达计数。
数据格式:CSV格式,每个CSV文件对应一种组织,包含基因表达的细胞计数信息。文件命名方式为“组织名称-counts.csv”。数据已进行预处理,包含细胞计数信息。
来源信息:数据来源未明确,但推测来源于生物医学研究,可能经过标准化和清洗。
该数据集适合用于基因表达分析、细胞类型鉴定、组织特异性基因表达研究和单细胞转录组学研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、基因组学和细胞生物学等领域的研究,如基因表达模式分析、细胞类型鉴定、组织特异性基因表达研究、细胞间通讯研究等。
行业应用:可用于药物研发,靶点发现,以及疾病机制研究。
决策支持:支持生物医药领域的决策制定,例如药物靶点的选择和治疗方案的优化。
教育和培训:作为生物信息学、基因组学、单细胞测序等相关课程的实训数据,帮助学生和研究人员深入理解基因表达调控和细胞异质性。
此数据集特别适合用于探索不同组织中基因表达的差异,以及细胞类型特异性的基因表达模式,帮助用户实现基因功能研究、疾病机制探索等目标。