数据集概述
本数据集围绕西方蜜蜂（Apis mellifera）线粒体基因组展开，通过分析十八个亚种的完整线粒体基因组，探究其进化与生物地理历史，支持其起源于北非或中东的结论，为蜜蜂系统发育研究提供数据支持。
文件详解
该数据集按不同分析路径分类存储，包含序列数据、系统发育分析输入文件及结果文件，具体如下：
- 序列数据文件（.phy格式）:
- 位于P123/、P12/、P12RNA/目录下，如apisP123.phy、apisP12.phy、apisP12RNA.phy，为系统发育分析的原始序列文件。
- IQ-Tree分析文件（位于各路径IQ-Tree/目录下）:
- 输入文件: partition.nex（分区设置文件）、partition.nex.bionj（BIONJ树文件）
- 结果文件: partition.nex.iqtree（IQ-Tree结果文件）、partition.nex.treefile（最终树文件）、partition.nex.contree（共识树文件）、apisP123 w branch lengths.pdf（带分支长度的树可视化PDF）、apisP123 wo branch lengths.pdf（无分支长度的树可视化PDF）
- PhyloBayes分析文件（位于各路径PhyloBayes/目录下）:
- 结果文件: CAT_GTR_chain2.con.tre（贝叶斯树文件）、bpcomp.con.tre（分支支持度比较树文件）、apisP123 w branch lengths.pdf（带分支长度的树可视化PDF）
适用场景
- 进化生物学研究: 分析西方蜜蜂的系统发育关系与亚种分类
- 生物地理学研究: 探究西方蜜蜂的起源地与扩散路径
- 基因组学分析: 研究蜜蜂线粒体基因组的进化模式
- 系统发育方法比较: 对比不同算法（IQ-Tree、PhyloBayes）对蜜蜂系统发育推断的影响
