西非蛇类毒液的比较转录组学数据

数据集概述

本数据集包含西非特有Africonus和Varioconus属13种食虫芋螺毒液腺转录组测序结果及毒液库比较分析数据,基于系统发育框架研究芋螺毒素前体的多样性、共享性及进化特征,涉及毒素超家族组成、表达水平等核心内容。

文件详解

  • ReadMe.xlsx(XLSX格式):数据集说明文件,包含数据结构、文件用途及使用指引等信息
  • BLAST_db_conotoxins.fasta(FASTA格式):芋螺毒素序列的BLAST数据库文件,用于序列比对分析
  • cap_protein_alignment.phy(PHY格式):芋螺相关蛋白质序列的比对文件,支持系统发育分析
  • Conotoxins_Hormones_Proteins_aa.fasta(FASTA格式):芋螺毒素、激素及蛋白质的氨基酸序列文件
  • Conotoxins_Hormones_Proteins_nt.fasta(FASTA格式):芋螺毒素、激素及蛋白质的核苷酸序列文件
  • Conus_mitogenomes_alignment.phy(PHY格式):芋螺线粒体基因组序列的比对文件
  • PCA-Composition_comparisons.zip(ZIP格式):主成分分析(PCA)及组成比较相关的压缩数据文件
  • RSEM_and_EBSeq.zip(ZIP格式):包含RSEM表达定量及EBSeq差异表达分析结果的压缩文件
  • Trinity_assemblies.zip(ZIP格式):Trinity转录组组装结果的压缩文件

数据来源

论文“Comparative transcriptomics of the venoms of continental and insular radiations of West African cones”

适用场景

  • 芋螺毒素进化研究:分析不同芋螺物种毒素前体的多样性、共享性及系统发育信号
  • 毒液功能组学分析:研究食虫芋螺基本毒液工具包(T、O1、O2、M超家族)的功能及表达特征
  • 物种间毒素差异比较:对比Africonus和Varioconus属芋螺毒素超家族组成及丰度差异
  • 捕食策略分子机制研究:分析食虫与食鱼芋螺毒素超家族(A、S超家族)的表达差异及功能收敛性
  • 生物分子资源开发:基于毒素序列数据库挖掘潜在的药用或研究用生物活性肽资源
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 198.59 MiB
最后更新 2026年2月12日
创建于 2026年2月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。