数据集概述
本数据集包含一篇关于新世界鼠尾草(Salvia subgenus Calosphace)植物锚定杂交富集方法试点研究的系统发育基因组数据,涵盖未过滤和过滤的矩阵文件及分区文件,还包括用于数据过滤的R脚本,共十六个文件,存储于一个目录下。
文件详解
该数据集包含一个目录及其中的文件,具体说明如下:
- 主目录: Phylogenomic matrices and partition files from A pilot study applying the plant Anchored Hybrid Enrichment method to New World sages (Salvia subgenus Calosphace; Lamiaceae)/
- 系统发育基因组矩阵文件(.phy格式,共十五个):
- 过滤数据集文件: 如Calosphace_Filtered_dataset_SR_5_448Partitions.phy、Calosphace_Filtered_dataset_SR_10_448Partitions.phy等,包含不同过滤条件下的系统发育基因组矩阵与分区信息
- 未过滤数据集文件: 推测包含未经过滤的原始系统发育基因组矩阵数据
- 代码文件(.R格式,共一个):
- Supplementary_data_1_Script.R: 用于过滤数据集的R脚本文件
适用场景
- 植物系统发育研究: 用于分析新世界鼠尾草(Salvia subgenus Calosphace)的系统发育关系
- 基因组数据分析方法验证: 可验证植物锚定杂交富集方法在系统发育研究中的应用效果
- 生物信息学方法研究: 用于测试和比较不同数据过滤策略对系统发育分析结果的影响
- 植物分类学研究: 为新世界鼠尾草的分类学研究提供基因组层面的数据支持