数据集概述
该数据集包含用于测试系统发育模型层级的代码与数据，聚焦于解决DNA替代过程随进化历史变化时标准马尔可夫模型的数学不一致问题，对比Lie Markov模型与GTR模型的性能表现。
文件详解
- 文档类文件：
- README.txt：TXT格式，说明数据集包含的代码、数据及论文关联信息，提及软件为研究用途开发
- LieMarkov.pdf：PDF格式，可能为研究论文或核心分析报告
- supplementary_material.pdf：PDF格式，补充材料文档
- 代码与可执行文件：
- test.sh：SH格式，测试脚本
- LMM.jar：JAR格式，Java可执行文件
- Java_Source.tgz：TGZ格式，Java源代码压缩包
- LieMarkov.nb：NB格式，可能为Notebook文件
- 数据文件：
- likelihoods.ods：ODS格式，似然值数据文件
适用场景
- 系统发育模型研究：分析异质替代率下不同模型的一致性与性能
- 进化生物学分析：探究DNA替代过程随进化历史的变化规律
- 生物信息学方法验证：测试Lie Markov模型层级在多样生物数据集上的应用效果
- 计算生物学工具开发：参考模型实现代码与测试脚本
