系统基因组学_福尔马林固定标本_百年蛇类标本的基因组学研究数据

数据集概述

本数据集围绕百年福尔马林固定/液浸蛇类标本的系统基因组学研究展开,包含通过改良DNA提取 protocol 结合高通量测序获得的遗传数据,以及标本信息、实验方案、系统发育分析结果等相关文件,可支持博物馆标本在现代系统发育研究中的应用验证。

文件详解

  • 数据压缩包
  • 文件名称:all_snakes_dataset1_informative_sites.inf.taxon.zip、ESM3_Phylips&trees.zip、contigs.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含蛇类标本的信息位点数据集、系统发育分析相关的Phylips文件与树文件、基因组组装的contigs序列等核心研究数据
  • 标本与文库制备表
  • 文件名称:Final_Specimen&LibraryPrep.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:记录标本信息及文库制备的详细数据,支撑实验过程的可追溯性
  • 提取方案文档
  • 文件名称:Extraction_protocol_Jan26_2017.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:包含改良的DNA提取实验方案,为类似标本的遗传数据获取提供方法参考

数据来源

论文“Phylogenomics using formalin-fixed and 100+ year old intractable natural history specimens”

适用场景

  • 博物馆标本遗传数据恢复技术研究: 验证改良DNA提取 protocol 对福尔马林固定标本的适用性
  • 蛇类系统发育分析: 结合百年标本与现代样本的遗传数据构建系统发育树,探究物种演化关系
  • 珍稀蛇类物种分类研究: 支持如印度Xylophis stenorhynchus等罕见蛇类的系统发育位置解析
  • 生物多样性研究: 挖掘博物馆标本在现代生物多样性研究中的应用价值
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 33.44 MiB
最后更新 2026年1月28日
创建于 2026年1月28日
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