数据集概述
本数据集是论文《亚马逊河微生物降解陆地有机物的宏基因组与群体基因组学研究》的补充材料,包含12个附录文件,均为PDF格式,涵盖基因比对、蛋白质家族分析、宏基因组NMDS分析等研究细节,支撑论文核心研究结论。
文件详解
该数据集包含12个PDF格式的附录文件,具体说明如下:
- Apendice_1_Metagenomas_utilizadas_na_geracao_do_AMnrGC.pdf:PDF格式,用于构建AMnrGC的宏基因组信息
- Apendice_3_Proteinas_de_referencia_e_familias_de_proteinas_utilizadas.pdf:PDF格式,参考蛋白质及所用蛋白质家族信息
- Apendice_4_Avaliacao_de_grupos_de_co_montagem_usada_para_construir_o_AMnrGC.pdf:PDF格式,构建AMnrGC所用共组装组的评估信息
- Apendice_5_Numero_de_genes_relacionados_a_cada_funcao_de_diferentes_estilos_de_vida.pdf:PDF格式,不同生活方式下各功能相关基因数量信息
- Apendice_6_NMDS_de_metagenomas_ordenados_por_abundancias_de_familias_genicas.pdf:PDF格式,按基因家族丰度排序的宏基因组NMDS分析
- Apendice_7_Principais_familias_de_proteinas_marcadoras_utilizadas.pdf:PDF格式,主要标记蛋白质家族信息
- Apendice_12_Alinhamento_do_gene_lacZ_de_Escherichia_coli_e_seus_ortologos_do_AMnrGC.pdf:PDF格式,大肠杆菌lacZ基因与其AMnrGC同源基因的比对信息
数据来源
Universidade Federal de São Carlos(巴西联邦圣卡洛斯大学)
适用场景
- 微生物学研究:分析亚马逊河微生物群落结构与功能基因分布
- 宏基因组学分析:探索环境微生物基因家族丰度与代谢通路特征
- 分子生物学研究:验证基因同源性比对及蛋白质家族分类方法
- 生物信息学方法应用:评估共组装组构建、NMDS分析等技术在环境微生物研究中的应用效果