数据集概述
本数据集为Hoyer et al.(2019)论文的补充Excel文件,包含针对拟南芥AGO1、AGO7和AGO10基因上游调控因子的十二组自动化酵母单杂交(Y1H)筛选结果,以候选直接上游转录因子(TF)的排名表格形式呈现,辅助研究人员快速获取关键候选调控因子信息。
文件详解
- 文件名称:ranked-TF-tables-supplement-for-Hoyer-et-al-Y1H.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含多个工作表,其中第一个工作表描述各列的含义;其余工作表对应十二组Y1H筛选的候选转录因子排名表格,具体字段需参考首工作表说明。
数据来源
论文“Hoyer et al. (2019)”(DOI: 10.1002/pld3.102)
适用场景
- 植物基因调控机制研究:分析拟南芥AGO1、AGO7、AGO10基因的直接上游转录因子,探究其表达调控网络。
- 转录因子功能验证:基于候选TF排名,筛选优先级靶标进行后续分子生物学实验验证。
- 植物小RNA通路研究:结合AGO家族基因功能,解析转录因子对小RNA通路关键基因的调控作用。
- 数据整合分析:与Zenodo记录(1345229)中的原始数据和代码结合,复现或扩展筛选结果分析。