数据集概述
本数据集包含硬粒小麦'Kronos'的染色体水平基因组组装及相关突变分析数据，含外显子捕获和启动子捕获测序的突变识别结果，采用MAPS流程分析并通过SnpEff预测变异效应，数据使用遵循多伦多协议的预发布共享原则。
文件详解
- 文件名称及格式：
- Kronos_v1.1_Exome-capture_annot_v2.1_MAPS.zip：ZIP压缩文件，包含外显子捕获测序的突变分析数据
- Kronos_v1.1_Promoter-capture_annot_v2.1_MAPS.zip：ZIP压缩文件，包含启动子捕获测序的突变分析数据
- 核心VCF文件字段说明：
- Type：变异类型（Substitution/Indel，即替换/插入缺失）
- RH：是否来自残留杂合性区域（True/False）
- Confidence：突变置信度（High/Medium/Low，即高/中/低）
- Threshold：突变检测参数（HetMinCov{x}HomMinCov{y}）
- Mapping：测序读段映射类型（Unique/Multi，即唯一映射/多映射）
适用场景
- 小麦基因组学研究：分析硬粒小麦'Kronos'的染色体水平基因组结构与功能
- 突变体分析：研究EMS诱导突变在外显子和启动子区域的分布及效应
- 分子育种应用：挖掘与农艺性状相关的功能变异位点
- 比较基因组学：开展硬粒小麦与其他小麦品种的基因组差异分析
