用于基准测试aseQC的人工污染ASE数据集

数据集概述

本数据集是为基准测试aseQC工具生成的人工污染ASE数据，通过向40个GEUVADIS样本系统性掺入"污染者"样本的RNA-seq读数，在20个污染阈值下模拟RNA-seq与基因分型不匹配情况。

文件详解

• 文件名称: PejLab/Contaminated_ASE-preprint-aseQC.zip
• 文件格式: ZIP压缩包
• 内容说明: 包含40个GEUVADIS样本在20个污染阈值下的人工污染ASE数据，用于模拟RNA-seq/基因分型不匹配场景

适用场景

• 生物信息学工具测试: 用于评估和验证aseQC工具在处理污染ASE数据时的性能表现
• 计算生物学研究: 支持RNA-seq数据分析中污染检测与校正方法的开发与比较
• 基因组学基准测试: 为基因表达分析中allele-specific表达数据的质量控制提供标准化测试数据集
• 生物信息学教育: 可作为教学案例，展示人工模拟实验数据在生物信息学工具开发中的应用