数据集概述
本数据集围绕植物多物种地上(绿色部分)和地下(土壤)样本的DNA提取优化协议展开,旨在解决NGS分析中植物群落评估缺乏标准化DNA提取方法的问题。协议通过优化裂解后可溶性化合物沉淀和pH标准化步骤,提升DNA质量与产量,已通过36个草地样地ITS2区域 metabarcoding 文库构建验证,适用于基础实验室环境。
文件详解
- 文件名称:ITS_NGS_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,未提供具体字段信息,推测包含与植物多物种样本DNA提取优化协议相关的实验数据、操作流程或测序结果,支持NGS-based分析中植物群落的分类鉴定。
数据来源
论文“Optimized DNA extraction from a large plant multi-species volume of below- and aboveground samples for NGS-based analysis”
适用场景
- 植物群落生态学研究:用于草地等生态系统中地上地下植物多物种样本的DNA提取,支持基于NGS的物种分类鉴定。
- 生物多样性监测:为保护主义者、研究人员和生物多样性管理者提供评估生态系统健康与稳定性的工具。
- DNA提取方法优化:分析优化步骤(如可溶性化合物沉淀、pH标准化)对植物样本DNA质量和产量的影响。
- 高通量测序应用:验证优化协议在metabarcoding文库构建中的有效性,支持大规模植物多物种样本的NGS分析。