油水混合物中脂质的粗粒化分子动力学模拟数据集

数据集概述

本数据集记录了使用粗粒化分子动力学模拟技术研究油水混合物中脂质自组装行为的过程与结果,采用MARTINI力场简化分子模型,平衡计算效率与细节精度,包含模拟数据、图像及分析文件等61个文件。

文件详解

  • 模拟数据与分析文件:
  • 无扩展名文件(如ATT00007、frame 3、frame 2):可能为模拟原始输出或中间数据文件
  • .xvg格式文件(如pressure.xvg、temperature.xvg、rdf_cn_water_PO4.xvg):包含压力、温度等模拟统计数据,以及径向分布函数(RDF)相关的密度分析结果
  • .ndx格式文件(popc_h2o_new.ndx):分子动力学模拟中的索引文件,用于定义原子组
  • 图像文件:
  • .jpg格式文件(如rdf_water_DEC.jpg、rdf_water_GLI2.jpg):共21个,为径向分布函数分析结果图
  • .jpeg格式文件(如bilayer frame 2.jpeg、frame 3.jpeg):共3个,为模拟过程中的脂质结构帧图像
  • .jpeg popch2o格式文件(frame 2 .jpeg popch2o):脂质与水体系的结构帧图像
  • 文档文件:
  • Coarse-grain molecular dynamics simulations of lipids in oil-water mixtureREP.pdf:PDF格式的模拟研究报告

适用场景

  • 分子动力学模拟研究:分析脂质在油水界面的自组装机制与结构变化
  • 生物物理分析:探究脂质双分子层形成过程中的热力学与动力学特性
  • 计算化学方法验证:评估MARTINI粗粒化力场在复杂流体体系中的适用性
  • 图像分析:通过模拟帧图像研究脂质聚集结构的演化规律
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.11 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。