数据集概述
本数据集围绕Z-DNA/Z-RNA与人类疾病的关联展开,涉及Zα结构域蛋白家族(如ADAR、ZBP1)对左 handed Z-DNA/Z-RNA的高亲和力结合机制,以及ADAR、DICER1功能缺失与Aicardi-Goutières综合征、年龄相关性黄斑变性等疾病的关系,还包括Z形成位点与信号识别颗粒位点的重叠对Alu逆转录转座子入侵的限制作用,共包含2个文件。
文件详解
- README_for_Z-DNA.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Z-DNA相关序列的核心字段说明,如start(起始核苷酸位置)、end(终止核苷酸位置)、length(ZHUNT3输出的序列长度)、dl(delta linkage,详见ZHUNT文档)、wl(delta writhe,详见ZHUNT文档)、score(Z-score)、sequence(核苷酸序列)、AS(碱基的anti-syn构象)、chr(染色体)、id(染色体特有ID,用于Bioconductor包Genomic Ranges合并的序列)、open(Genomic Ranges起始位置)、close(Genomic Ranges终止位置)、gap=(Genomic Ranges合并序列相关信息)等
- Z-DNA.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:为压缩归档文件,推测包含与Z-DNA相关的核心数据内容,具体字段可参考README_for_Z-DNA.txt的说明
适用场景
- Z-DNA/Z-RNA疾病机制研究: 分析Zα结构域蛋白(ADAR、ZBP1等)与Z-DNA/Z-RNA的结合对先天免疫、RNA编辑等过程的调控及疾病关联
- 罕见病致病机制分析: 探究ADAR p150功能缺失突变导致Aicardi-Goutières综合征的分子机制
- 退行性疾病研究: 研究DICER1功能缺失与年龄相关性黄斑变性的关联及Alu介导的疾病路径
- 基因组稳定性研究: 分析Z形成位点与信号识别颗粒位点的重叠对Alu逆转录转座子入侵的限制作用
- 生物信息学序列分析: 基于Z-DNA相关序列的核苷酸位置、构象、Z-score等字段开展基因组范围的Z-DNA分布及功能分析