数据集概述
本数据集用于解析环节动物门游走亚门针毛虫类（Aciculata）的系统发育关系，包含转录组矩阵、物种树（ASTRAL和串联超矩阵方法构建）及用于数据探索的基因树，支持相关类群进化关系的研究。
文件详解
- 根目录文件：
- 80pAciculata.supermatrix.fa：FA格式文件，可能为80%物种覆盖度的超矩阵序列文件
- 80pAciculata.supermatrix.fa.treefile：树文件，对应超矩阵构建的物种树
- Alignments.zip：压缩文件，可能包含序列比对结果
- GeneTrees_ASTRAL.zip：压缩文件，可能包含基因树及ASTRAL分析相关文件
- 70p_EXTENDED_IQTREE.zip：压缩文件，可能包含70%物种覆盖度扩展数据集的IQTREE分析结果
- 80p_IQTREE.zip：压缩文件，可能包含80%物种覆盖度数据集的IQTREE分析结果
- AUTest目录：
- testtopologies.tre：树文件，包含用于AU检验的拓扑结构
- AUtest.log：日志文件，记录AU检验的运行结果
- FastGenes目录：
- 以gene开头的MAFFT.fa文件（如gene_200422_200591_part.fa_MAFFT.fa）：FA格式文件，可能为快速进化基因的MAFFT比对结果
- FastConcat.fasta：FASTA格式文件，可能为快速进化基因的串联序列
- FastConcat.fasta.treefile：树文件，对应快速进化基因串联构建的物种树
- FastConcat.fasta.partition.txt：文本文件，记录序列分区信息
- FastGenes.txt：文本文件，可能为快速进化基因列表
- SlowGenes目录：
- 以gene开头的MAFFT.fa文件（如gene_231895_232135_part.fa_MAFFT.fa）：FA格式文件，可能为慢速进化基因的MAFFT比对结果
- SlowConcat.fasta：FASTA格式文件，可能为慢速进化基因的串联序列
- SlowConcat.fasta.treefile：树文件，对应慢速进化基因串联构建的物种树
- SlowConcat.fasta.partition.txt：文本文件，记录序列分区信息
适用场景
- 环节动物系统发育研究：解析针毛虫类内部及相关类群的进化关系
- 基因组进化分析：探究不同进化速率基因对系统发育推断的影响
- 系统发育方法比较：比较ASTRAL、IQTREE等方法构建物种树的差异
- 进化拓扑检验：利用AU检验验证不同系统发育假设的合理性
