数据集概述
本数据集围绕植物系统发育推断中公共序列数据的局限性展开，包含基于GenBank数据构建的陆生植物属级系统发育树及相关分析文件，通过系统发育数据决定性理论探讨数据稀疏性对推断的限制，为理解公共数据库在植物系统学研究中的应用价值提供支持。
文件详解
- 系统发育树文件：
- RAxML_bestTree.generic_tree.rooted：无根系统发育树文件，可能为RAxML软件生成的最优树
- generic.ultrametric.tre：超度量树文件，用于展示时间校准后的系统发育关系
- 配置与分区文件：
- generic_tree_dated.config：系统发育树时间校准配置文件
- Streptophytina_by_genus_partitions.part.reduced：植物类群按属划分的分区文件
- 序列比对与代码文件：
- Streptophytina_by_genus_alignment.phy.reduced.zip：植物属级序列比对数据压缩包，包含PHY格式文件
- code.zip：分析代码压缩包，可能包含系统发育推断相关的脚本
- 补充文档：
- File_S1.pdf：补充材料文档，可能包含研究方法、结果或讨论的详细信息
适用场景
- 植物系统学研究：分析公共序列数据对植物系统发育关系推断的支持程度
- 进化生物学分析：评估缺失数据对系统发育信号强度及分支支持度的影响
- 生物信息学方法验证：测试系统发育推断算法在高缺失数据场景下的性能
- 公共数据库应用评估：探讨GenBank等数据库在大规模系统发育研究中的局限性与优化方向
