脂质组学LC_MS分析离群值检测支持工具数据集

数据集概述

本数据集围绕脂质组学LC-MS分析的离群值检测展开,包含人胰腺癌细胞系(PANC-1)脂质提取样本的原始质谱数据、两种软件(MS DIAL与Lipostar)的处理结果,以及用于离群值检测分析的Python代码笔记本,为解决质谱软件输出不一致问题提供数据支持。

文件详解

  • 原始质谱数据文件:
  • 以.wiff、.wiff2为格式,如20230201 PANC1_1400cell1.wiff2、20230201 Blank13.wiff等,共14个文件,包含LC-MS原始检测输出
  • 以.timeseries.data和.wiff.scan为格式,如20230201 PANC1_1400cell1.timeseries.data、20230201 Blank13.wiff.scan等,共14个文件,为质谱检测的辅助数据
  • 软件处理结果文件:
  • inputfile_msdial.csv:CSV格式,包含MS DIAL处理后的脂质特征数据,字段有Name(名称)、RT(保留时间)、Formula(分子式)、LipidClass(脂质类别)
  • MSDIAL_LCMS_SoftwareOutput.xlsx:Excel格式,MS DIAL软件的输出结果
  • inputfile_lipostar.csv:CSV格式,包含Lipostar处理后的脂质特征数据,字段有LipidClass(脂质类别)、Name(名称)、Formula(分子式)、RT(保留时间)
  • Lipostar_LCMS_SoftwareOutput.xlsx:Excel格式,Lipostar软件的输出结果
  • 分析代码文件:
  • LCMS Lipidomics Analysis Notebook.html:HTML格式,含Python代码的Jupyter笔记本,用于离群值检测分析

适用场景

  • 脂质组学研究:评估不同LC-MS数据分析软件的输出一致性
  • 生物信息学方法开发:验证机器学习(支持向量机回归)在质谱数据离群值检测中的应用
  • 质谱数据处理优化:分析共洗脱、脂质相似性导致的软件错误问题
  • 生物标志物发现:提升LC-MS脂质特征识别的置信度与可重复性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 542.85 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
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