数据集概述
本数据集为博士论文第一章的补充文件,围绕转座子(TE)群体水平入侵引发真菌病原体基因组扩张的研究主题,包含实验验证相关的图表源数据和补充说明文件,支持对该生物学机制的深入分析。
文件详解
该数据集包含19个文件,具体说明如下:
- TXT格式源数据文件(共8个):
- 示例文件:Figure1_sourcedata1_nonrefValidation.txt、Figure4_sourcedata1_top_loci_information.txt等
- 字段示例(以Figure1_sourcedata1_nonrefValidation.txt为例):name(名称)、isolate2(分离株)、orient_read(读长方向)、end(末端)、length_region(区域长度)、number_of_reads(读长数量)、exp_no_of_reads_per_endpoint(每个端点预期读长数)、poisson(泊松值)、locus(基因座)、wickersoft、hierarchy2(层级分类)等
- 内容用途:记录实验验证数据、基因座信息、转座子存在缺失情况等原始或处理后的数据
- PDF格式图表文件(共11个):
- 示例文件:Figure7_Supplement1_genome_size_expansion.pdf、Figure1_Supplement3_GC_bias.pdf、Figure4_Supplement1_additional_top_loci.pdf等
- 内容用途:展示基因组大小扩张、GC偏倚、基因座分布等研究结果的图表及补充说明
适用场景
- 分子生物学研究:分析转座子入侵对真菌病原体基因组结构的影响机制
- 基因组学分析:探究转座子驱动基因组扩张的群体水平规律
- 真菌病理学研究:揭示转座子活动与真菌病原体进化的关联
- 实验验证方法参考:为转座子相关实验的验证设计提供数据支持