数据集概述
本数据集为留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性研究的支撑数据,包含该鸣禽高地种群中棕色与灰色羽毛表型的表型记录、基因组变异及微卫星等分子数据,用于揭示染色体1上新基因座对黑色素表型多态性的调控机制及平衡选择下的进化过程。
文件详解
- 文件名称:
Localities_Morphs_individuals_VCF.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含个体的采样地点、羽毛表型类型(棕色/灰色)及关联的VCF数据索引信息
- 文件名称:
All_data_microsats_spectro_melanindosage.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:整合了微卫星标记数据、羽毛光谱测量数据及黑色素含量定量数据
- 文件名称:
Highlands_dataset.recode.vcf
- 文件格式:VCF
- 字段映射介绍:高地种群个体的基因组变异位点数据,记录单核苷酸多态性(SNP)等遗传标记信息
数据来源
论文“A novel locus on chromosome 1 underlies the evolution of a melanic plumage polymorphism in a wild songbird”
适用场景
- 表型进化机制研究:分析染色体1新基因座对绣眼鸟羽毛颜色多态性的调控作用
- 种群遗传学分析:利用微卫星和VCF数据探究羽毛颜色变异的种群遗传结构
- 平衡选择验证:通过等位基因频率动态模拟验证灰色表型等位基因的非固定性进化模式
- 表型-基因型关联分析:关联羽毛光谱、黑色素含量等表型数据与基因组变异位点