数据集概述
本数据集包含论文“Genome compartmentalization predates species divergence in the plant pathogen genus Zymoseptoria”修订版中生成和分析的基因组组装与注释文件，共15个文件。涵盖Zymoseptoria属多个物种的软屏蔽基因组序列、基因注释信息、功能注释结果及表达数据，支持植物病原体基因组区室化研究。
文件详解
- 基因组组装文件（.fa格式，共6个）
- 文件名称：Zpa63_softmasked_for_publication.fa、Zp13_softmasked_for_publication.fa、Zt05_softmasked_for_publication.fa、Zb87_softmasked_for_publication.fa等
- 内容：Zymoseptoria属不同菌株的软屏蔽基因组序列
- 基因组注释文件（.gff3格式，共6个）
- 文件名称：Zp13_2019_for_publication.gff3、Zt05_2019_for_publication.gff3、Zpa63_2019_for_publication.gff3、Zb87_2019_for_publication.gff3等
- 内容：基因组的基因结构注释信息
- 功能注释结果文件（.tab格式，共2个）
- 文件名称：Annotations_2018_genomes_for_publication.tab、Annotations_emapper_2018_genomes_for_publication.tab
- 内容：2018年基因组的功能注释及eggNOG-mapper注释结果
- 表达数据文件（.xlsx格式，共1个）
- 文件名称：Expression_data_Ztritici_inplanta.xlsx
- 内容：Ztritici在植物体内的表达数据
数据来源
论文“Genome compartmentalization predates species divergence in the plant pathogen genus Zymoseptoria”
适用场景
- 植物病原体基因组结构研究: 分析Zymoseptoria属基因组区室化特征及其进化意义
- 基因组注释与功能分析: 利用.gff3和.tab文件研究基因结构与功能注释信息
- 基因表达分析: 通过.xlsx文件探究Ztritici在植物体内的基因表达模式
- 物种分化进化研究: 基于基因组组装数据探讨Zymoseptoria属物种分化前的基因组特征
