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对照组与帕金森病患者中脑多巴胺细胞空间转录组数据集_GeoMx
2025年12月16日 30 154 38
数据集概述 本数据集包含通过Nanostring GeoMx技术分析的对照组、偶发性路易体病、早/晚期帕金森病患者中脑TH+细胞的空间转录组数据，共分析三百四十八个感兴趣区域，提供原始及处理后计数数据与元数据的R Seurat对象，用于帕金森病相关的空间转录组研究。 文件详解 文件名称: edwards-pmdbs-spatial-geomx-...
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EBI_BioImages_Omero_Vitessce_Based_OMERO插件可视化测试完整数据
2025年12月15日 30 99 92
数据集概述 本数据集专为OMERO平台的omero-vitessce插件测试设计，包含图像、细胞分割、转录组及配置文件等多类型数据，支持插件功能验证与交互可视化测试。 文件详解 图像文件：...
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肿瘤相关巨噬细胞功能表型分子机制研究数据集
2025年12月14日 30 117 94
数据集概述 本数据集围绕肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）功能表型的分子机制展开，包含空间转录组、空间代谢组及两者匹配的多组学数据，用于研究肿瘤微环境中TAMs表型形成的调控因素及重编程机制。 文件详解 文件名称: Alignment.zip，文件格式: ZIP压缩包，内容: 空间转录组与空间代谢组数据的点对匹配结果，包含统一坐标系下的空间关联信息...
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肿瘤空间转录组LSGI处理数据集
2025年12月13日 30 120 24
数据集概述 该数据集包含论文《空间转录组数据的可解释空间梯度分析》中八十七个肿瘤空间转录组（ST）数据集的LSGI处理结果，提供了分析所需的教程文档，支持空间转录组数据的注释与可视化研究。 文件详解 核心数据文件（共八十七个）: 文件格式: RDS (.rds) 命名示例:...
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两种小鼠帕金森病模型纹状体空间转录组数据集
2025年12月12日 30 161 157
数据集概述 本数据集包含基于两种小鼠帕金森病（PD）模型的纹状体空间转录组（ST）数据，聚焦PD样病理不同阶段和机制下的细胞类型特异性及空间基因表达变化，为PD病理机制研究提供空间维度的基因表达数据支持。 文件详解 文件名称: cragg-mouse-spatial-visium-striatum_README.pdf 文件格式: PDF (.pdf)...
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人类乳腺癌单细胞与空间分辨图谱空间转录组数据集
2025年12月11日 30 176 64
数据集概述 该数据集包含与Wu等人2021年研究相关的人类乳腺癌空间转录组数据，涵盖六例原发性乳腺癌样本的测序及空间信息，为乳腺癌空间基因表达研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: raw_count_matrices.tar.gz，文件格式: .tar.gz（压缩包），内容: Spaceranger处理的原始计数矩阵 文件名称:...
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DBiTplus_Based_数据分析脚本数据集
2025年12月8日 30 13 5
数据集概述 本数据集为DBiTplus手稿相关的分析脚本压缩包，包含用于处理CODEX、CellScape和DBiT-seq数据的脚本文件，支持相关实验数据的分析工作。 文件详解 文件名称: DBiTplus__scripts.zip 文件格式: ZIP（压缩包格式） 内容说明: 压缩包内包含用于分析CODEX、CellScape和DBiT-...
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SpaceXR_Galaxy_Based_生物医学测试数据完整集合
2025年12月8日 30 124 100
数据集概述 该数据集为spacexr Galaxy包装器测试数据，包含27个文件，涉及细胞、基因相关生物医学内容，涵盖表格数据、R语言数据文件、PDF文档及R代码等多种类型，为测试相关工具或流程提供数据支持。 文件详解 表格数据文件（.tabular格式，共6个）： metadata.tabular：元数据表格...
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正常肾上腺皮质空间转录组学处理数据集
2025年12月7日 30 157 147
数据集概述 该数据集包含人类正常肾上腺皮质的空间转录组学处理数据，涉及两个正常肾上腺样本。数据由Visium空间转录组技术生成，经Space Ranger软件处理，包含样本的图像文件与过滤后的表达矩阵，为研究肾上腺皮质的空间基因表达模式提供支持。 文件详解 该数据集包含18个文件，按样本分为表达矩阵文件和图像相关文件，具体如下： -...
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Scigenex_Based_基因表达分析与空间数据科学实践完整数据
2025年12月7日 30 33 21
数据集概述 该数据集是Scigenex R库提供的示例数据集子集，包含基因、空间等相关数据文件，用于展示库内函数和类的使用方法，同时提供生成示例数据的代码文件。 文件详解 数据文件（.rda格式）：共6个，包括pbmc3k_medium.rda、lymph_node_tiny_2.rda等，存储基因表达或细胞聚类相关数据...
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FFPE组织成像空间转录组平台系统性基准测试H5AD文件数据集
2025年12月7日 30 124 115
数据集概述 该数据集包含用于FFPE组织成像空间转录组平台系统性基准测试的H5AD文件压缩包，为相关技术平台的性能评估提供数据支持。 文件详解 文件名称：IST_benchmarking_H5AD.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容说明：压缩包内包含与FFPE组织成像空间转录组平台系统性基准测试相关的H5AD格式文件，具体字段及内容需解压后查看...
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无测序全基因组空间转录组数据集
2025年11月27日 30 166 86
数据集概述 本数据集基于RAEFISH技术构建，包含在完整组织中以分子分辨率进行的无测序全基因组空间转录组数据。覆盖人类约两万三千个、小鼠约两万两千个转录本，可揭示转录本亚细胞定位、细胞类型特异性转录组及细胞间相互作用的基因程序。 文件详解 该数据集按组织类型和技术类型分类存储，均为MATLAB数据格式（.mat），具体如下： -...
