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Cryo_EM_Supplementary_气胞结构研究补充数据2023
2026年1月22日 30 71 2
数据集概述 本数据集为气胞Cryo-EM结构研究的补充数据，包含2D类平均图像、AlphaFold2预测模型、GvpC蛋白对接结果及气体孔道分析文件，用于支持气胞伪原子模型构建、生物发生机制推导及进化保守性验证。 文件详解 2Dclasses_AnaMega_SeamsEdgesWallTips.zip 文件格式：ZIP...
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ECOD_AlphaFold2_Source_蛋白质结构分类评估补充数据
2026年1月21日 0 91 48
数据集概述 本数据集是论文“Assessing Structural Classification Using AlphaFold2 Models through ECOD-based Comparative...
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酶底物分类SDRs和SAM甲基转移酶_SAM_MTases_酶底物分类数据集
2026年1月20日 30 120 25
数据集概述 本数据集包含358个短链脱氢酶/还原酶（SDRs）和953个S-腺苷甲硫氨酸依赖甲基转移酶（SAM-MTases）的序列信息、AlphaFold2模型三维结构及底物分类标签，支持酶底物分类研究，共14个文件。 文件详解 序列文件 文件名称：SDR_sequences.fasta、SAM_sequences.fasta 文件格式：FASTA...
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AlphaFold2_ColabFold_基于序列纯化的多构象状态预测结果数据
2026年1月19日 30 180 110
数据集概述 本数据集包含通过ColabFold使用纯化序列生成的不同状态蛋白质预测结构。每个序列预测生成40个结构，由8个随机种子各生成5个结构组成，整体以压缩包形式存储，用于支持蛋白质多构象状态的精确预测研究。 文件详解 压缩包文件 文件名称：purified_seqs.zip 文件格式：ZIP...
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MDPI_Supplementary_Data_植物蛋白结构预测与分类补充数据
2026年1月19日 30 36 4
数据集概述 本数据集为植物蛋白相关研究的补充数据，包含五张预测蛋白结构的补充图和四张植物蛋白分类表格，总计九个文件。图由AlphaFold2预测生成，含模型置信度信息；表格列出多种模式植物和作物中的PLD、DGK、PI-LPC、RBOHs蛋白信息，支持植物蛋白结构与分类研究。 文件详解 补充图文件（Supplementary Figures）...
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基于AlphaFold2的SARS_CoV_2奥密克戎刺突蛋白与ACE2受体构象及结合机制分析结果_压缩文件
2025年12月29日 30 37 24
数据集概述 本数据集围绕SARS-CoV-2刺突蛋白Omicron变体与ACE2受体的复合物展开，通过AlphaFold2构建的结构集合及分子动力学模拟，探索其构象景观与结合机制，为病毒-受体相互作用的研究提供支撑。 文件详解 压缩文件 文件名称：SpikeProteinsResultsUpdated.zip 文件格式：ZIP...
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SARS_CoV_2_基于_B_1_1_529_变异株的刺突蛋白受体结合域结构及中和抗体相互作用预测数据_1_0_0
2025年12月27日 30 146 92
数据集概述 本数据集包含使用AlphaFold2和HADDOCK工具预测的SARS-CoV-2 B.1.1.529变体刺突蛋白受体结合域（RBD）结构，以及该结构与中和抗体的结合相互作用预测结果。数据旨在揭示B.1.1.529变体RBD的潜在结构变化，及其对疫苗有效性的影响。数据集仅包含一个压缩文件。 文件详解 文件名称：SARS-...
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AlphaFold2局限性克服的蛋白质序列深度突变扫描与稳定性选择数据集
2025年12月18日 30 196 121
数据集概述 本数据集围绕克服AlphaFold2对天然同源序列依赖的局限性展开，包含通过深度突变扫描和稳定性选择生成的人工同源蛋白质序列数据，用于提升稀疏序列家族蛋白质的结构预测准确性。 文件详解 该数据集包含5个压缩文件，具体说明如下： - Sibs-Seq.zip：ZIP格式压缩文件，内容未提供详细预览 -...
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Zenodo_MotifBench_Based_AlphaFold2与ESMFold骨架评估完整数据
2025年12月13日 30 31 29
数据集概述 该数据集包含MotifBench平台下，使用AlphaFold2和ESMFold工具对RFdiffusion生成的蛋白骨架进行评估的结果数据，为蛋白结构生成模型的性能验证提供支持。 文件详解 文件名称：evaluation.zip 文件格式：ZIP压缩包...
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AlphaFold2单体模型用于小线性基序预测基准测试数据集
2025年12月11日 30 166 105
数据集概述 该数据集包含用于基准测试AlphaSLiM基序发现工具的单体AlphaFold2 Multimer v3预测结果，按"含SLiM的伙伴"分类存储，每个文件夹包含AlphaSLiM脚本所需的五个.json评分文件，支持小线性基序预测相关研究。 文件详解 文件名称:...
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AlphaFold2蛋白质序列比对改进研究数据集
2025年12月10日 30 127 67
数据集概述 本数据集包含论文《Highly significant improvement of protein sequence alignments with AlphaFold2》的补充表格、图表及数据集压缩包，核心内容围绕AlphaFold2对蛋白质序列比对性能的提升展开，为生物信息学领域相关研究提供数据支持。 文件详解...
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MotifBench_RFdiffusion_Based_蛋白质骨架评估完整数据_注_所有文件名均遵循中文主导原则_保留_MotifBench_和_RFd...
2025年12月10日 30 58 16
数据集概述 该数据集是MotifBench项目的一部分，包含使用AlphaFold2和ESMFold工具对RFdiffusion生成的蛋白质骨架进行评估的结果，提供了蛋白质结构生成与评估的相关数据支持。 文件详解 文件名称: scaffolds.zip：压缩文件格式，可能包含RFdiffusion生成的蛋白质骨架结构文件。 文件名称:...
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hRSK2蛋白相互作用伙伴单体AlphaFold2模型_用于小线性基序预测
2025年12月9日 30 1 0
数据集概述 该数据集包含220个hRSK2相互作用伙伴蛋白的单体AlphaFold2 Multimer v3预测模型，每个伙伴蛋白单独建模，未包含RSK2。模型按伙伴蛋白分类存放，为小线性基序（SLiM）预测提供基础数据。 文件详解 文件名称: ZENODO_hRSK2_SLiM_predictions_monomer.zip 文件格式: ZIP压缩包...
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牙龈卟啉单胞菌T9SS组分复合物的AlphaFold2预测结构数据集
2025年12月8日 30 83 67
数据集概述 本数据集包含通过AlphaFold2预测的牙龈卟啉单胞菌IX型分泌系统（T9SS）核心膜复合物相关结构数据，涉及PorK-PorN二聚体、PorK-PorN环、PorM二聚体与PorL五聚体复合物、PorK与PorM结构域2-4二聚体复合物等多种复合物的预测结构，为研究T9SS核心膜复合物的组成与功能提供结构基础。 文件详解...
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马里巴韦抑制pUL97激酶机制及耐药突变的AlphaFold2结构预测计算分析数据集
2025年12月7日 30 189 176
数据集概述 本数据集为基于AlphaFold2预测的pUL97激酶结构，开展马里巴韦抑制机制及耐药突变分析的计算数据，包含结构预测的误差评估与可信度分数文件，支持抗病毒药物作用机制的生物信息学研究。 文件详解 文件名称：atompLDDT score_pUL97_kinase.pdf 文件格式：PDF...
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单体SARS_CoV_2主蛋白酶溶液域动力学NMR残留偶极耦合测量数据集
2025年12月4日 30 106 66
数据集概述 本数据集为论文《Solution Domain Dynamics of Monomeric SARS-CoV-2 Main Protease Revealed by Optimized NMR Residual Dipolar Coupling...
