找到17个数据集

分类: 公开数据 标签: PHYLIP格式

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  • 担子菌植物细胞壁分解基因家族数据集

    2026年2月15日 30 133 122

    数据集概述 本数据集包含44个担子菌门基因组中与植物细胞壁分解相关的42个基因家族的补充表格、蛋白质序列文件、系统发育分析文件及系统发育树文件。数据用于研究不同营养策略真菌的基因组成差异,揭示其分解机制,共101个文件。 文件详解 补充表格文件...
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  • Amblypygi_Based鞭蛛全球系统发育与DNA序列研究数据

    2026年1月27日 30 95 17

    数据集概述 本数据集为鞭蛛(Amblypygi)全球系统发育研究相关数据,包含DNA序列比对、UCE序列比对及说明文档,支持鞭蛛分子系统发育分析、分化时间估算等研究,共5个文件,覆盖3种文件格式。 文件详解 README.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、数据采集与处理方法、文件内容说明等信息...
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  • Sarracenia_Based_北美食肉植物属系统发育关系研究数据

    2026年1月23日 30 6 2

    数据集概述 本数据集为研究北美食肉植物Sarracenia属系统发育关系的目标捕获法分析结果,包含75个样本的199个核基因序列及叶绿体基因组序列,用于解析该年轻分支(<300万年)的进化关系、生物地理起源及基因树异质性,共8个文件。 文件详解 基因树文件...
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  • AculeateDryadData_膜翅目昆虫系统发育基因组学研究数据

    2026年1月22日 30 9 4

    数据集概述 本数据集为膜翅目昆虫系统发育基因组学研究数据,包含用于解析蚂蚁、蜜蜂和胡蜂等针尾部膜翅目主要类群进化关系的基因组数据及分析文件,旨在为理解真社会性等特征的演化提供系统发育框架,共包含2个文件。 文件详解 文件名称:README_for_AculeateDryadData.txt 文件格式:TXT...
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  • Lacerta_Genome_Based_爱琴海绿蜥蜴辐射演化基因组标记数据

    2026年1月20日 30 128 94

    数据集概述 本数据集包含爱琴海绿蜥蜴(Lacerta trilineata–pamphylica群)辐射演化研究的基因组标记数据,用于检验爱琴海生物地理分化模型(隔离分化、陆地扩散、岛屿踏脚石扩散),分析种群结构、祖先分布区及演化时间线,共包含4个文件。 文件详解 Lacerta_uSNPs_STRUCTURE.ustr 文件格式:ustr...
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  • Dryad_Myrmelachista_Based蚁_植物共生趋同演化研究数据

    2026年1月19日 30 85 51

    数据集概述 本数据集为蚁-植物共生系统趋同演化研究相关数据,包含Myrmelachista属蚂蚁的超保守元件(UCE)基因组学数据、祖先状态重建文件、系统发育树文件等。研究通过分子系统发育分析揭示该属蚂蚁从机会主义到专性共生的独立演化事件,支持趋同演化假说,共包含七个文件。 文件详解 说明文档 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • Necturus_maculosus_Based_水生蝾螈种群结构与基因流基因组评估数据

    2026年1月13日 30 176 20

    数据集概述 本数据集为水生蝾螈(Necturus maculosus)种群结构与基因流的基因组评估数据,包含美国肯塔基州三个流域(肯塔基河、利金河、金尼科尼克河)的基因组分析相关文件,用于探究河流网络结构、地理屏障等因素对种群遗传分化的影响。 文件详解 文件名称:bpp.zip 文件格式:ZIP...
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  • Bacidia_fuscoviridis_Based_北美温带地衣科属关系系统发育研究数据

    2026年1月12日 30 65 5

    数据集概述 本数据集为论文“Bacidia fuscoviridis, another overlooked sorediate crustose lichen widely distributed in temperate eastern North...
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  • 新西兰溪流鱼类延迟适应性辐射研究数据集

    2025年12月20日 30 161 61

    数据集概述 本数据集围绕新西兰Gobiomorphus鰕虎鱼的适应性辐射展开研究,通过系统基因组数据结合贝叶斯方法,分析其分化时间、形态特征演化与物种形成的关系,揭示适应性辐射在无竞争谱系环境下的缓慢启动现象。 文件详解 该数据集包含17个文件,覆盖分析结果、补充材料、配置文件等,具体说明如下: - 结果图表文件: -...
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  • 胡萝卜沿海亚种变异基因型测序数据集

    2025年12月23日 30 207 205

    数据集概述 本数据集聚焦胡萝卜属(Daucus)中沿海"gummifer"形态型亚种的遗传变异,通过基因型测序(GBS)分析288份样本,涵盖地中海、大西洋沿岸及巴利阿里群岛等区域,识别出29041个过滤后的单核苷酸多态性(SNPs),为该类群的分类与系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含4个文件,具体说明如下: - 图表文件: -...
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  • RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415

    2025年12月23日 30 34 6

    数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料,包含经实验验证的植物NLR(核苷酸结合寡聚化结构域样受体)相关序列、注释及分析结果,涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据,为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件,具体说明如下: - 补充表格文件: -...
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  • 树懒进化历史与生物地理学古线粒体基因组数据集2019

    2025年12月23日 30 16 10

    数据集概述 该数据集是《Current Biology》2019年发表论文的补充材料,包含树懒古线粒体基因组的捕获序列、多格式基因组数据集、系统发育树文件、祖先特征重建结果及实验方案等,为研究树懒的进化历史与生物地理学提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 序列捕获文件: - Delsuc-...
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  • 胎盘哺乳动物褪黑素合成与信号通路平行退化基因组证据数据集2021

    2025年12月20日 30 22 5

    数据集概述 本数据集为研究胎盘哺乳动物褪黑素合成与信号通路平行退化的基因组证据补充材料,包含相关基因的系统发育树、选择压力分析模型及失活突变验证数据,支持对AANAT、ASMT、MTNR1A、MTNR1B基因功能演化的研究。 文件详解...
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  • 马达加斯加西北部侏儒壁虎分子系统学与新物种描述数据集

    2025年12月18日 30 28 18

    数据集概述 本数据集为论文《马达加斯加西北部神秘侏儒壁虎Lygodactylus ornatus的分子系统学及L. verticillatus群新物种描述》的配套数据,包含原始DNA比对及系统发育树文件,支持对该区域侏儒壁虎物种分类与进化关系的研究。 文件详解...
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  • 北美树花属_梅衣科_分子研究数据集

    2025年12月13日 30 50 13

    数据集概述 本数据集聚焦北美树花属(Alectoria)地衣的分子系统发育研究,通过ITS和Mcm7两个核基因分析9个类群的48个样本,探讨5个与A. sarmentosa相关或易混淆类群的分类界限,提出临时分类处理建议及新物种组合,并提供北美树花属物种检索表。 文件详解...
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  • 基于模型的物种界定数据集_合并物种是否存在生殖隔离

    2025年12月6日 30 69 12

    数据集概述 该数据集围绕基于多物种合并模型的物种界定方法展开实证检验,以果蝇属为研究对象,对比合并模型推断的物种边界与传统生殖隔离标准的一致性,探究生殖隔离程度对物种界定结果的预测作用。 文件详解 文件名称: python_R_scripts.zip,文件格式: ZIP压缩包,包含用于数据分析的Python和R语言脚本文件 文件名称:...
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  • 硅藻进化的生态机遇与限制支持数据集2016

    2025年12月5日 30 206 171

    数据集概述 该数据集是硅藻进化研究的支持数据,包含542个分类单元(540种硅藻及2种波利多门藻)的序列比对、特征数据、系统发育树及相关分析脚本,为研究硅藻进化的生态机遇与限制提供基础数据支持。 文件详解 序列与拓扑文件 Nakov-etal-542-taxon-alignment-...
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