数据集概述
该数据集是《Current Biology》2019年发表论文的补充材料，包含树懒古线粒体基因组的捕获序列、多格式基因组数据集、系统发育树文件、祖先特征重建结果及实验方案等，为研究树懒的进化历史与生物地理学提供数据支持。
文件详解
该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下：
- 序列捕获文件:
- Delsuc-CurrBiol-2019_capture_baits.fasta: FASTA格式，基于现生异关节总目线粒体基因组和重建祖先序列设计的捕获序列诱饵
- 基因组数据集文件:
- Delsuc-CurrBiol-2019_dataset.fasta: FASTA格式，用于系统发育重建和分子定年的线粒体基因组数据集
- Delsuc-CurrBiol-2019_dataset.phylip: PHYLIP格式，用于系统发育重建和分子定年的线粒体基因组数据集
- Delsuc-CurrBiol-2019_dataset_partitions.nex: NEXUS格式，带分区信息的线粒体基因组数据集
- 系统发育树文件:
- Delsuc-CurrBiol-2019_FigS2_RAxML_MLtree_100BP_nexus_for_FigTree.tree: NEXUS格式，RAxML推断的最大似然树（100次重复自举检验）
- Delsuc-CurrBiol-2019_FigS3_IQ-TREE_MLtree_100BP_nexus_for_FigTree.tree: NEXUS格式，IQ-TREE推断的最大似然树（100次重复自举检验）
- Delsuc-CurrBiol-2019_FigS4_MrBayes_consensus_nexus_for_FigTree.tree: NEXUS格式，MrBayes推断的贝叶斯一致树
- Delsuc-CurrBiol-2019_FigS5_PhyloBayes_consensus_nexus_for_FigTree.tree: NEXUS格式，PhyloBayes推断的贝叶斯一致树
- Delsuc-CurrBiol-2019_FigS6_PhyloBayes_chronogram_nexus_for_FigTree.tree: NEXUS格式，PhyloBayes推断的贝叶斯时间树
- 实验方案文件:
- Delsuc-CurrBiol-2019_Megatherium_bone_extraction_protocol.pdf: PDF格式，大地懒骨骼样本制备的详细实验方案
- 祖先特征重建文件:
- Delsuc-CurrBiol-2019_ML_ancestral_reconstruction_MOL_constraint.pdf: PDF格式，基于分子拓扑约束的最大似然祖先特征重建
- Delsuc-CurrBiol-2019_ML_ancestral_reconstruction_MORPH_constraint.pdf: PDF格式，基于形态拓扑约束的最大似然祖先特征重建
- Delsuc-CurrBiol-2019_MP_ancestral_reconstruction_MOL_constraint.pdf: PDF格式，基于分子拓扑约束的最大简约祖先特征重建
- Delsuc-CurrBiol-2019_MP_ancestral_reconstruction_MORPHO_constraint.pdf: PDF格式，基于形态拓扑约束的最大简约祖先特征重建
- 模型选择结果文件:
- Delsuc-CurrBiol-2019_TableS1_PartitionFinder_RAxML_best_partition_scheme.txt: TXT格式，RAxML的PartitionFinder最佳分区方案结果
- Delsuc-CurrBiol-2019_TableS2_ModelFinder_IQ-TREE_best_partition_scheme.txt: TXT格式，IQ-TREE的ModelFinder最佳分区方案结果
- Delsuc-CurrBiol-2019_TableS3_PartitionFinder_MrBayes_best_partition_scheme.txt: TXT格式，MrBayes的PartitionFinder最佳分区方案结果
适用场景
- 古生物学研究: 分析树懒的进化历史、系统发育关系及生物地理分布
- 分子进化研究: 探究树懒线粒体基因组的进化模式与速率
- 古DNA技术应用: 验证古线粒体基因组捕获与分析方法的有效性
- 生物地理学研究: 重建树懒类群的时空分布格局与扩散路径
- 祖先特征重建: 研究树懒关键形态特征的演化历程
- 系统发育方法比较: 对比不同算法（RAxML、IQ-TREE、MrBayes等）推断系统发育树的差异
